如何使用Origin做热图?详细教程在这里 | 您所在的位置:网站首页 › 怎么用origin分区块颜色 › 如何使用Origin做热图?详细教程在这里 |
数据处理 大家都知道,转录组测序得到的基因表达量有多个,各个数据之间的差异是很大的,那么我们是需要首先要对基因在各个样本中的表达量进行归一化。为什么这么做呢,因为数据从最小值到最大值之间的范围太大,需要的色阶范围就很大,哪有这么大的色阶范围来描述呢,所以,我们要进行数据归一化,方便热图的展示。 现在常见的有两种方法:第一种呢,是对基因在样本中的表达量取对数;另外一种是z-score方法,其中以第二种应用更为广泛。所以我们用Z评分方法来进行数据归一化。 1. 打开Origin2019,输入数据 2. 选中所有数据,使用Z评分进行归一化处理 3. 然后我们的数据就自动在一个sheet生成了 4. 然后我们在下面右击新建一个sheet,输入数据,用这个数据作图 热图 1. 选中数据,选择热图选项 2. 那么最基本的热图就做出来了,我对字体和个别标签进行了调整,就得到了下图 3. 如何更换颜色呢?我们双击图层,选择填充颜色 4. 这里呢,可以双色填充,也可以多色填充。这里我们使用从黑到红色填充。 5. 看看效果 带标签的热图 1. 如果我们想要绘制带标签的数据图怎么办呢?在上面原图的基础上,双击图层,设置标签 2. 第二种办法,就是在作图的时候,直接选择使用带标签的热图进行作图就可以了 3. 然后重复上述操作就可以了 聚类分析的热图 1. 聚类分析的热图要使用到Origin里面的APP功能,首先我们先下载热图所需要的APP,这里我已经下载好了 2. 选中数据(这里我们使用原始数据就行),点击APP 3. 设置,将数据进行标准化(归一化),聚类进行行和列均可 4. 生成图谱,调整各个标签 5. 这就是本节讲的使用Origin做热图的教程,你学会了吗? 在线绘图工具 这里提供几个在线绘图工具,大家可以去探索发现。小工具有小工具的优点,快捷,迅速。大家看自己的选择吧,就可以! 1. Heatmapper http://www.heatmapper.ca/expression/ 2. ShinyHeatmap http://shinyheatmap.com 3. Morpheus https://software.broadinstitute.org/morpheus/ 4. Clustergrammer http://amp.pharm.mssm.edu/clustergrammer/ 征 稿 启 事 “医学方”始终致力于服务“医学人”,将最前沿、最有价值的临床、科研原创文章推送给各位临床医师、科研人员。返回搜狐,查看更多 |
CopyRight 2018-2019 实验室设备网 版权所有 |