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厉害了我的10X Genomics建库系统 ——你不知道的二代测序超长读长建库系统
以小编多年高通量测序从业经验,
毫不夸张,
从未见过这么神奇的建库技术平台:
10X Genomics
10X Genomics平台基于微滴的核酸标签分配系统,这个系统提供了数以百万级的携带唯一DNA标签编码(Barcode)的微滴,通过微流控技术,将这些标签分配给不同的DNA片段或单个细胞,实现了长片段DNA测序和单细胞分辨率的转录组测序。
The GemCode Technology Workflow
10X Genomics平台福利一 超长Linked-Reads
通过将来自同一长片段模板具有相同barcode的reads进行连接,输出超长Linked-Reads,彻底颠覆二代测序短读长限制,长度可达50-100Kb,实现前所未有的Reads长度。Linked-Reads可完美覆盖基因组结构变异信息,包括InDel、SV、CNV和融合基因,且结果可视化,呈现更直观。对于基因组de novo组装,超长Linked-Reads能够跨过基因组复杂结构区域,辅助复杂基因组组装。
STRUCTURAL VARIANTS view of a 50Kb homozygous deletion in NA12878(chr4:34,780,000-chr4:34,830,000.)
10X Genomics平台福利二 独特的Phasing技术 截至今日,10X Genomics平台是唯一可以实现染色体定相(Phasing)功能的建库技术平台,通过Phasing功能,结合Linked-Reads,可视化呈现单体型(Haplotypes)结果,对于遗传病和NIPT研究,无需提前知晓家族病史,即可获得致病突变信息。
HAPLOTYPES view of BRCA1 and BRCA2 in NA12878.
10X Genomics平台福利三 最高通量的单细胞研究 基于10X Genomics平台的单细胞转录组测序,同时可以获得1000-10000个细胞的表达信息,从而实现对细胞群体的划分与细胞群体间基因表达差异的检测,是肿瘤细胞异质性、免疫细胞群体检测以及胚胎发育研究的黄金方法。
Significant Genes and Cell Types
好了,今天的福利暂时发放到此,欲知每种解决方案如何,请听下回分解。
☑ 博奥晶典10x Genomics 平台解决方案 ☑ 10X Genomics基因组de novo组装解决方案 ☑ 10X Genomics全基因组重测序解决方案 ☑ 10X Genomics全外显子组测序解决方案 ☑ 10X Genomics单细胞转录组测序解决方案
未完待续…… http://mp.weixin.qq.com/s/e_VXhIVWHQvHnkBnjvS2Uw博奥晶典10X Genomics 建库系统
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