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小哥哥实验笔记之

2024-06-21 09:08| 来源: 网络整理| 查看: 265

1. SDS是一种阴离子去垢剂,在高温(55℃~65℃)条件下可以裂解细胞,使染色体离析、蛋白变性、释放出核酸;

2. 蛋白质、糖、脂类等都可以溶于80%乙醇,而DNA不溶于80%乙醇;

3. 磁珠吸附核酸原理:

(1)磁珠为核壳结构,中心为氧化铁内核,中层包裹封闭基质,外层为修饰的官能团(如图3所示)。

中层基质不同,磁珠的基本性质会有所不同; 修饰的官能团不同,磁珠的吸附特性会有所不同; 即便是相同的封闭基质和官能团,基质的包被工艺不同,会造成基质厚度、孔容、孔径、比表面积不同,所能吸附的颗粒粒径偏好也会有所不同; 即便是修饰相同的官能团,官能团修饰工艺不同,会造成官能团密度、臂长不同,所携带的表面电荷、斥力、氢键数量不同,吸附能力也会随之改变;

(2)由于磁珠Buffer一般为聚乙二醇(PEG)等有机溶剂,而这类有机溶剂(PEG沉淀蛋白、沉淀DNA,DNA连接反应中低浓度PEG作为聚合剂,增强载体与目的片段碰撞的机会;PEG还能保持溶液的粘度,使磁珠保持悬浮不易聚沉,也不易造成蛋白变性和非特异性吸附。)分离效果易受PH、温度等影响,温度低PEG也不易与水相完全互溶。

4. 磁珠法DNA提取相对传统酚抽提法、固相载体吸附法优势:

(1)操作简单快速:整个操作流程基本分为五步(裂解、结合、洗涤、干燥、洗脱;图4所示);

(2)质量稳定可靠:游离的磁珠与核酸的结合量更大,特异性的结合使得核酸纯度更高,且可通过控制磁珠表面基团来调节核酸回收量;

(3)全自动化操作:采用核酸提取仪可实现自动化、高通量操作,一键启动,即可实现几十甚至几百个样品的提取;

(4)安全无毒无害:试剂不含酚、氯仿等有毒化学试剂,完全符合现代化环保理念。

三. 磁珠法全血DNA提取流程

四. 提取过程中注意事项的总结

1. 实验前做好准备工作,准备好仪器、试剂、耗材等;

2. 实验前做好清洁工作:使用75%的酒精擦拭移液枪以及实验台;

3. 预先准备好试剂:如磁珠需提前30min平衡至室温;

4. 预先准备好仪器:提前开启水浴锅,调节好温度;

5. 在EP管盖上的样本编号,字迹要工整清晰,便于识别;

6. 取样前需将采血管上下轻轻颠倒混匀;

7. 裂解红细胞时注意观察样本,若离心后管子仍呈暗红色,需要根据情况适当增加裂解红细胞操作;

8. 实验中的吹打混匀的操作,要确保枪头不要离开液面以下,避免产生气泡;

9. 使用磁珠时,吸取上清的操作中,要注意不要扰动磁珠;

10. 实验中,干燥磁珠时,要注意避免过分干燥,过分干燥磁珠会降低DNA回收得率。

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