RNA 14. SCI 文章中差异表达基因之 蛋白互作网络 (PPI)

蛋白互作网络分析同样也是 SCI 文章中出现频率最高的分析方法，下面就给大家梳理一下流程！

另外大家都是私信我，现在有需要学习生信等问题可以扫码进群交流，如下：

前言

蛋白质互作网络（PPI, Protein-Protein Interaction Networks）是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成，来参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节。系统分析大量蛋白在生物系统中的相互作用关系，对了解生物系统中蛋白质的工作原理，了解疾病等特殊生理状态下生物信号和能量物质代谢的反应机制，以及了解蛋白之间的功能联系都有重要意义。

蛋白互作分析的工具包括 string 数据库也是一个在线工具，另外就是经典的网络作图软件 Cytoscape。

实例解析

我们就根据 RNA 12. SCI 文章中肿瘤免疫浸润计算方法之 CIBERSORT 结果来学习怎么绘制蛋白互作网络图。

1 数据读取

读取表达数据，由于我们挑选的都是免疫细胞，所以更加方便作图，选取其中的10个基因，如下：