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TBtools使用教程 一、 TBtools软件安装 下载地址: https://github.com/CJ-Chen/TBtools-Manual 点击安装包正常安装就可以 二、 TBtools提取DNA序列 打开TBtools,按照下图依次点击: 来到下图所示界面: 图一↑ 下面以从中牧一号cds序列提取已知基因号为例: ① 将中牧一号的cds序列拖到图一红框里,然后点击右边红字initialize 等待出现上图红框,点击确定 ② 选择一个文件夹作为输出文件夹,可直接将文件夹拖到图一黄框里,如下图红框所示: 然后需要手动写上输出文件名称(以.fasta结尾),如下图红框所示: ③ 在图一蓝框里输入提取的基因号,如下图红框所示: 注意:由图一蓝框的提示可知,支持三种提取序列的方式,第一种就是示例的输入基因号在cds序列中提取基因;第二种是在基因组序列中提取某一染色体上的部分序列,输入格式为“染色体编号 起始位置 结束位置”,如“chr3.1 77978413 77984644”;第三种方式提取某染色体的某一基因的部分序列,输入格式为“基因号 染色体号 起始位置 结束位置”,如“MS.gene06299.t1 locus=chr3.1 77978900 77980644”。 ④点击start,提取成功会弹出下图红框: 点击确定,然后找到刚才图一填写的输出位置,会生成一个fasta文件,即为我们提取的基因序列,如下图所示: |
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