干货

有几种缓冲液适用于天然双链 DNA 的电泳,它们包括 Tris -乙酸盐和 EDTA 缓冲液（pH 8.0， TAE ,也称为 E 缓冲液）、Tris -硼酸盐和 EDTA 电泳缓冲液（ TBE ）或 Tris -磷酸盐和 EDTA 电泳缓冲液（TPE ），工作浓度约50mmol/ L ，pH 7.5~7.8。各种电泳缓冲液通常配制成浓溶液于温室存放（见每种实验方案后的配方）。这些缓冲液都非常有效，选择哪一种使用主要看个人工作习惯。

三者之中 TAE 的缓冲容量最低，如长时间电泳会被消耗。此时凝胶的阳极一侧将发生酸性化，凝胶中向阳极迁移的溴酚蓝的颜色呈现从蓝紫色到黄色的变化。该颜色变化从pH 4.6开始，到pH 3.0终止。定期更换缓冲液或调换两个电极池的缓冲液可以防止 TAE 的消耗。TBE 和 TPE 比 TAE 花费稍贵些，但是它们有高得多的缓冲容量。

双链线状 DNA 片段在 TAE 中比在 TBE 或 TPE 中迁移速率快10%左右。对于高分子质量 DNA ，TAE 的分辨率高于 TBE 或 TPE ；对于低分子质量 DNA ，TAE 要差些。此差别也许解释下述现象：高度复杂混合物中的 DNA 片段，如哺乳类动物 DNA ,用 TAE 电泳可有较高分辨率。因此，用于分析复杂基因组的 Southern 印迹( Southern blot )均用 TAE 作为电泳缓冲液制备凝胶和电泳。超螺旋 DNA 在 TAE 中的电泳分辨率要好于 TBE 。