python热力图

利用热力图可以看数据表里多个特征两两的相似度。参考官方API参数及地址：

seaborn.heatmap(data, vmin=None, vmax=None, cmap=None, center=None, robust=False, annot=None, fmt=’.2g’, annot_kws=None, linewidths=0, linecolor=’white’, cbar=True, cbar_kws=None, cbar_ax=None, square=False, xticklabels=’auto’, yticklabels=’auto’, mask=None, ax=None, **kwargs)

热力图输入数据参数:

data:矩阵数据集，可以是numpy的数组（array），也可以是pandas的DataFrame。如果是DataFrame，则df的index/column信息会分别对应到heatmap的columns和rows，即pt.index是热力图的行标，pt.columns是热力图的列标

热力图矩阵块颜色参数:

vmax,vmin:分别是热力图的颜色取值最大和最小范围，默认是根据data数据表里的取值确定

cmap:从数字到色彩空间的映射，取值是matplotlib包里的colormap名称或颜色对象，或者表示颜色的列表；改参数默认值：根据center参数设定

center:数据表取值有差异时，设置热力图的色彩中心对齐值；通过设置center值，可以调整生成的图像颜色的整体深浅；设置center数据时，如果有数据溢出，则手动设置的vmax、vmin会自动改变

robust:默认取值False；如果是False，且没设定vmin和vmax的值，热力图的颜色映射范围根据具有鲁棒性的分位数设定，而不是用极值设定

热力图矩阵块注释参数:

annot(annotate的缩写):默认取值False；如果是True，在热力图每个方格写入数据；如果是矩阵，在热力图每个方格写入该矩阵对应位置数据

fmt:字符串格式代码，矩阵上标识数字的数据格式，比如保留小数点后几位数字

annot_kws:默认取值False；如果是True，设置热力图矩阵上数字的大小颜色字体，matplotlib包text类下的字体设置；官方文档：https://matplotlib.org/api/text_api.html#matplotlib.text.Text

热力图矩阵块之间间隔及间隔线参数：

linewidths:定义热力图里“表示两两特征关系的矩阵小块”之间的间隔大小

linecolor:切分热力图上每个矩阵小块的线的颜色，默认值是’white’

热力图颜色刻度条参数：

cbar:是否在热力图侧边绘制颜色刻度条，默认值是True

cbar_kws:热力图侧边绘制颜色刻度条时，相关字体设置，默认值是None

cbar_ax:热力图侧边绘制颜色刻度条时，刻度条位置设置，默认值是None

square:设置热力图矩阵小块形状，默认值是False

xticklabels, yticklabels:xticklabels控制每列标签名的输出；yticklabels控制每行标签名的输出。默认值是auto。如果是True，则以DataFrame的列名作为标签名。如果是False，则不添加行标签名。如果是列表，则标签名改为列表中给的内容。如果是整数K，则在图上每隔K个标签进行一次标注。 如果是auto，则自动选择标签的标注间距，将标签名不重叠的部分(或全部)输出

mask:控制某个矩阵块是否显示出来。默认值是None。如果是布尔型的DataFrame，则将DataFrame里True的位置用白色覆盖掉

ax:设置作图的坐标轴，一般画多个子图时需要修改不同的子图的该值

**kwargs:All other keyword arguments are passed to ax.pcolormesh

首先造一个数据表：

import seaborn as sns

import pandas as pd

import numpy as np

import matplotlib.pyplot as plt

% matplotlib inline

region = ['Azerbaijan','Bahamas', 'Bangladesh', 'Belize', 'Bhutan',

          'Cambodia', 'Cameroon', 'Cape Verde', 'Chile', 'China']  #10个

kind = ['Afforestation & reforestation', 'Biofuels', 'Biogas', 'Biomass', 'Cement']  #5个

np.random.seed(20180316)

arr_region = np.random.choice(region, size=(200,))

list_region = list(arr_region)

arr_kind = np.random.choice(kind, size=(200,))

list_kind = list(arr_kind)

values = np.random.randint(100, 200, 200)

list_values = list(values)

df = pd.DataFrame({'region':list_region,'kind': list_kind,'values':list_values})

df['kind'].value_counts()

将DataFrame数据表转化成“数据透视表”

import pandas as pd

pt = df.pivot_table(index='kind', columns='region', values='values', aggfunc=np.sum)  #数据透视表

pt  #index是行，columns是列，values是表中展示的数据，aggfunc是表中展示每组数据使用的运算

热力图矩阵块颜色参数

#cmap(颜色)

import matplotlib.pyplot as plt

% matplotlib inline

f, (ax1,ax2) = plt.subplots(figsize = (6,4),nrows=2)

# cmap用cubehelix map颜色

cmap = sns.cubehelix_palette(start = 1.5, rot = 3, gamma=0.8, as_cmap = True)

sns.heatmap(pt, linewidths = 0.05, ax = ax1, vmax=900, vmin=0, cmap=cmap)

ax1.set_title('cubehelix map')

ax1.set_xlabel('')

ax1.set_xticklabels([]) #设置x轴图例为空值

ax1.set_ylabel('kind')

# cmap用matplotlib colormap

sns.heatmap(pt, linewidths = 0.05, ax = ax2, vmax=900, vmin=0, cmap='rainbow')

# rainbow为 matplotlib 的colormap名称

ax2.set_title('matplotlib colormap')

ax2.set_xlabel('region')

ax2.set_ylabel('kind')

#center的用法(颜色)

f, (ax1,ax2) = plt.subplots(figsize = (6, 4),nrows=2)

cmap = sns.cubehelix_palette(start = 1.5, rot = 3, gamma=0.8, as_cmap = True)

sns.heatmap(pt, linewidths = 0.05, ax = ax1, cmap=cmap, center=None )

ax1.set_title('center=None')

ax1.set_xlabel('')

ax1.set_xticklabels([]) #设置x轴图例为空值

ax1.set_ylabel('kind')

# 当center设置小于数据的均值时，生成的图片颜色要向0值代表的颜色一段偏移

sns.heatmap(pt, linewidths = 0.05, ax = ax2, cmap=cmap, center=200) 

ax2.set_title('center=3000')

ax2.set_xlabel('region')

ax2.set_ylabel('kind')

#robust的用法(颜色)

f, (ax1,ax2) = plt.subplots(figsize = (6,4),nrows=2)

cmap = sns.cubehelix_palette(start = 1.5, rot = 3, gamma=0.8, as_cmap = True)

sns.heatmap(pt, linewidths = 0.05, ax = ax1, cmap=cmap, center=None, robust=False )

ax1.set_title('robust=False')

ax1.set_xlabel('')

ax1.set_xticklabels([]) #设置x轴图例为空值

ax1.set_ylabel('kind')

sns.heatmap(pt, linewidths = 0.05, ax = ax2, cmap=cmap, center=None, robust=True )

ax2.set_title('robust=True')

ax2.set_xlabel('region')

ax2.set_ylabel('kind')

热力图矩阵块注释参数

#annot(矩阵上数字),annot_kws(矩阵上数字的大小颜色字体)matplotlib包text类下的字体设置

import numpy as np

np.random.seed(20180316)

x = np.random.randn(4, 4)

f, (ax1, ax2) = plt.subplots(figsize=(6,6),nrows=2)

sns.heatmap(x, annot=True, ax=ax1)

sns.heatmap(x, annot=True, ax=ax2, annot_kws={'size':9,'weight':'bold', 'color':'blue'})

# Keyword arguments for ax.text when annot is True.  http://stackoverflow.com/questions/35024475/seaborn-heatmap-key-words

#fmt(字符串格式代码，矩阵上标识数字的数据格式，比如保留小数点后几位数字)

import numpy as np

np.random.seed(0)

x = np.random.randn(4,4)

f, (ax1, ax2) = plt.subplots(figsize=(6,6),nrows=2)

sns.heatmap(x, annot=True, ax=ax1)

sns.heatmap(x, annot=True, fmt='.1f', ax=ax2)

热力图矩阵块之间间隔及间隔线参数

#linewidths(矩阵小块的间隔),linecolor(切分热力图矩阵小块的线的颜色)

import matplotlib.pyplot as plt

f, ax = plt.subplots(figsize = (6,4))

cmap = sns.cubehelix_palette(start = 1, rot = 3, gamma=0.8, as_cmap = True) 

sns.heatmap(pt, cmap = cmap, linewidths = 0.05, linecolor= 'red', ax = ax) 

ax.set_title('Amounts per kind and region')

ax.set_xlabel('region')

ax.set_ylabel('kind')

#xticklabels，yticklabels横轴和纵轴的标签名输出

import matplotlib.pyplot as plt

f, (ax1,ax2) = plt.subplots(figsize = (5,5),nrows=2)

cmap = sns.cubehelix_palette(start = 1.5, rot = 3, gamma=0.8, as_cmap = True)

p1 = sns.heatmap(pt, ax=ax1, cmap=cmap, center=None, xticklabels=False)

ax1.set_title('xticklabels=None',fontsize=8)

p2 = sns.heatmap(pt, ax=ax2, cmap=cmap, center=None, xticklabels=2, yticklabels=list(range(5)))

ax2.set_title('xticklabels=2, yticklabels is a list',fontsize=8)

ax2.set_xlabel('region')

#mask对某些矩阵块的显示进行覆盖

f, (ax1,ax2) = plt.subplots(figsize = (5,5),nrows=2)

cmap = sns.cubehelix_palette(start = 1.5, rot = 3, gamma=0.8, as_cmap = True)

p1 = sns.heatmap(pt, ax=ax1, cmap=cmap, xticklabels=False, mask=None)

ax1.set_title('mask=None')

ax1.set_ylabel('kind')

p2 = sns.heatmap(pt, ax=ax2, cmap=cmap, xticklabels=True, mask=(pt