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跟着JoVE学作图:R语言ggplot2做簇状柱形图并添加显著性标记的完整示例

2024-06-26 16:05| 来源: 网络整理| 查看: 265

添加显著性标记用到的是ggsignif包中的geom_signif()函数

在昨天推文的基础上,如果是利用带重复的原始数据作图,然后利用geom_signif()函数作图的时候我遇到了报错,暂时还不知道如何解决。等找到原因了再来介绍。

查找资料的过程中找到了一篇论文

https://www.jove.com/t/60139/nest-building-behavior-as-an-early-indicator-behavioral-deficits Nest Building Behavior as an Early Indicator of Behavioral Deficits in Mice

(这个期刊好特殊,还提供做实验的视频)

论文里有一幅图

提供了代码和数据,今天的推文来学习一下他的代码是如何写的

首先是准备数据

他这里是直接通过代码输入数据,没有将数据存储到文件里

代码语言:javascript复制Genotype = c("Wildtype", "APOE4", "Wildtype", "APOE4", "Wildtype", "APOE4", "Wildtype", "APOE4") Material = c("Shredded paper","Shredded paper","Square","Square","Bedding","Bedding","Twist", "Twist") Mean = c(4.77,3.52, 2.57, 1.39, 2.73, 1.73, 2.63, 1.30) se = c(0.16, 0.24, 0.36, 0.06, 0.25, 0.26, 0.29, 0.05) df = data.frame(Genotype, Material, Mean, se) df

最后的数据如下

相当于是用原始数据先算了平均值和标准差

这里的赋值符号他直接用的等于号=,而没有用



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