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抗核抗体阳性对自身免疫病的诊断、病情判断、疗效评价中具有重要的意义，但就目前研究结果而言，抗核抗体一般不能转阴。 首先，抗核抗体非单一抗体，而是一组具有不同临床意义的自身抗体组合，如抗双链DNA抗体、抗Sm抗体、抗组蛋白抗体、抗着丝点抗体、抗SSA抗体、抗SSB抗体等。不同类型的抗核抗体临床意义各不相同，但整体而言，抗核抗体在自身免疫病诊断中的意义要大于对病情判断、疗效评价的作用，即抗核抗体像一个标签一样存在于自身免疫病患者体内，用以区别非自身免疫病人群。 其次，抗体抗体是由于人体内免疫系统功能异常，不能识别人体正常组织成分，而将其当作外来“异物”，诱发异常免疫反应所产生的自身抗体。其水平高低与病情轻重程度有一定的相关性，当病情严重，或处于急性期时，抗核抗体水平较高；经过激素、免疫抑制剂治疗有效后，抗核抗体水平可以下降。但由于目前自身免疫病不能根治，通过药物治疗可以抑制体内异常免疫反应，因此抗核抗体合成减少，水平下降，少数患者抗核抗体水平甚至可降至检测范围最低值以下，表现为“阴性”，但若病情活动，其水平可再次升高。 因此，抗核抗体阳性一般是不能转阴的，其临床意义更多在于自身免疫病的诊断。患者更应该关注病情整体控制情况，预防和减少并发症的出现。
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