武藤游戏

小时候的游戏从爷爷那里得到了一盒从埃及遗迹发现的宝物（千年积木）碎片，据说完成这个谜题的人许下的愿望可以成真。八年间不断地拼凑着，在即将完成之际发现少了一块，其实是被学校里的不良少年，他的同学城之内克也偷走并丢进了河里。游戏在找碎片的途中被风纪委员牛尾哲牛尾大神传说的开始（流水的主角，铁打的牛尾）拦下，以替他报仇为借口揍了城之内一顿，趁机向游戏索要保护费。但游戏却选择保护城之内，于是同样遭到牛尾殴打。内心受到触动的城之内从河里捡起了自己之前故意丢掉的宝物碎片，游戏终于完成了千年积木。

完成积木后，每当游戏遇到危险时，会在积木的影响下不自觉地转化为“另一个自己（魔王样）”。“另一个自己（魔王样）”会和心术不正的人玩“黑暗游戏”以达到惩治对方的目的。

早期和魔王样玩“黑暗游戏”的人其中有一部分（通常是行径比较恶劣的）下场不是变成植物人，就是留下难以治愈的心理创伤[3]。

（这个阶段游戏自己对“另一个自己”地所作所为并不清楚（记忆是空白的），但是转化为“另一个自我”状态的游戏会被认识游戏的旁人记得，并且从身高气场上可以感受的出来并非表游戏本人。）

慢慢地游戏也变得开朗起来，和同班同学城之内克也、本田广成为了好朋友。

游戏的爷爷（鸡酱）经营着“龟游戏店”，他有一张十分珍视的青眼白龙，在卡片游戏悄然流行起来的时候，被海马集团的董事长、天才少年游戏的同校生海马濑人觊觎，偷走了爷爷的青眼白龙。游戏和“另一个自己（暗游戏）”向海马发起了卡片游戏的挑战并取胜，之后暗游戏执行黑暗游戏的惩罚把海马关到了怪兽的世界中一夜。

社长从此染上再也戒不掉的牌瘾和找准了再也忘不掉的牌友（宿敌）

（这时的卡片只有等级、ATK、DEF，以及游戏中带的简单的场地效果，是最早的游戏王卡片游戏）

海马对于输给游戏之事一直耿耿于怀，为了一雪前耻打败游戏，精心策划了一个复仇计划——从世界各地收集了三张青眼白龙，并强迫游戏爷爷使用自己公司海马集团新开发的立体影像系统决斗。之后，在自己建设的大型室内游乐场“海马乐园”开幕前夜海马邀请武藤游戏造访自家，之后在开幕式上与武藤双六对决并击败了武藤双六后恶意夺走了他的青眼白龙并将其撕毁宿敌一言不合就撕牌的由来（大雾），然后当着游戏的面把双六关到了挂在影像系统的柜中执行“死亡体验”[4]，以此胁迫游戏挑战海马乐园中的死亡主题乐园“DEATH-T”输了真会死那种主题。

游戏和伙伴们一同踏上了征服DEATH-T的旅程，并通过了职业军人把守的玩具枪战、击倒了守关的杀人魔、游历了绝对不能叫的鬼屋、在天井里跳落下的方块等，一步一步的走到了楼顶。游戏切换为“另一个自己（暗游戏）”的姿态用爷爷的卡组和拥有三张青眼白龙的海马决斗。一举神抽抽到无敌怪兽艾克佐迪亚（黑暗大法师），击败了海马，也粉碎了海马的黑暗心灵。

DM版动画版将此段大幅压缩并删改为第一集。主要是针对海马的动机与行为，因为DEATH-T当中海马恶劣得不像样子。

社长从此患上再也治不好的青眼白龙癌

（社长在游戏后花了很长时间重新恢复了理智，并未像漫画初期的人被魔王样玩成半死不活的状态，这时游戏的“另一个自己（魔王样）”转为“另一个我（暗游戏）”）

游戏班上来了一位神秘的美少年转学生貘良了，并和游戏等人成为了朋友，之后邀请他们前往自己家里玩RPG游戏。在游戏中大家突然昏倒，清醒后发现自己变成了RPG游戏的角色，而暗游戏现身，和被千年智慧轮中的邪恶人格操作的貘良进行“黑暗游戏”。游戏与伙伴们和之后加入的表貘良齐心协力，打败了RPG棋盘里的魔王，也暂时消灭了暗貘良的意识，表貘良夺回了身体控制权。

DM版动画版将这段删改为“决斗者王国篇”中使用卡片决斗的一集。

国际幻象社董事长帕加索斯·J·克罗佛多觊觎海马集团的立体影像技术，想通过收购来独占，但海马公司的之后漫画里再也没出现的董事会开出了必须打败武藤游戏的条件。于是帕加索斯利用千年眼的力量绑架了游戏爷爷的灵魂鸡酱又住院了！，以爷爷性命作为威胁，强迫游戏参加自己公司主办的“决斗者王国大赛”。

一路过五关斩六将的游戏终于得以和帕加索斯决斗，但帕加索斯所持有的千年眼拥有看破对手心理的能力占据上风。正当暗游戏手足无措的时候，表游戏在内心呼唤着他——“你能听得到我的声音吗？另一个我。”两人第一次在心灵房间相见并确定了彼此的存在——“你愿意把力量借给我吗？”“嗯。”

（在此之前，暗游戏之前并不知道表游戏的存在，表游戏也仅是隐约感觉的到暗游戏的存在。）

两人（夫夫）开始一次合作，使用心灵交换的战术，最终召唤出黑混沌之魔术师击败了帕加索斯的王牌千年纳祭魔，救出了所有被帕加索斯用千年眼封印的灵魂，获得了“决斗者王国大赛”的冠军。战后的帕加索斯则被暗貘良偷袭杀死并夺走了千年眼。

DM版动画里千年眼只是被夺走，帕加索斯并没有死亡。

（经过这场决斗，暗游戏对表游戏的称呼转变为了喜闻乐见的“相棒（AIBO）”，大家也认识到了暗游戏和武藤游戏（表游戏）并非一个人。）

（但是唯独社长直到结尾都执着的把两个游戏统一称作“游戏”。）

游戏班上后来又来了一位新转学生——御伽龙儿，夺走了游戏的千年积木，以此为筹码要挟游戏用自己新开发的“D.D.D”（Dungeon Dice Duel（Different Dimension Demon））龙骰游戏决斗。表游戏凭借自己出色的游戏能力，在这个自己第一次玩的游戏里战胜了御伽。

御伽的父亲曾和游戏的爷爷武藤双六通过禁忌游戏“恶魔盘”争夺千年积木，输掉了比赛的他寿命锐减，面容迅速苍老，本是想通过儿子向其复仇，但不承认儿子的失败，假意归还千年积木给表游戏实则妄图自己戴上，因为不是被千年神器所选择的人受到了诅咒，挣扎中不慎打碎了积木，也碰翻了店里的烛台引发大火。因为积木被牢牢钉在柱子上，表游戏太瘦弱无法取下，为了能和积木里的“另一个我（暗游戏）”再次相见，表游戏不顾火势凶猛开始拼凑积木。闻讯赶到的城之内，本田，杏子在店门口被拦下，城之内不顾劝阻冲进火场，找到了拼好了积木却已经筋疲力尽昏倒的游戏。在积木里暗游戏的意识声音的提醒下，运用杠杆原理翘掉了积木上的钉子，城之内抱着紧握着积木的游戏走出了火场——“你们看，他在大火中拼好了积木，一直紧握在手中不愿意放开，这就是...锁链的羁绊。”

DM动画版对这一篇章进行了大量删改，御伽龙儿变成是为帕加索斯复仇，决斗方式也变为“D.D.M（Dungeon Dice Monster）”，夺走千年积木要挟表游戏的变成了后面和被马利克用千年锡杖洗脑的基斯，火场救碎掉的老公的情节也变成和基斯决斗后的故事。

住院后的游戏很快恢复了精神，用和积木里的暗游戏一起组的卡组轻松战胜了探病的城之内，伙伴们很开心游戏恢复的很快。一直在意千年积木的杏子也询问了游戏第一次拼好积木许下的愿望，但游戏只是腼腆地回答：“作为秘密吧。”，之后的对话让杏子愈加相信游戏的千年积木里寄居着另一个游戏的意识，是个不属于这个世界，终究要回到遥远的归宿的灵魂。

游戏和城之内讨论战术时，临床看报纸的病人注意到游戏的千年积木上的特别的眼睛，和在报纸上刊登的古埃及展览的广告里的埃及考古局官员伊西丝·伊修达尔的项链上的眼睛十分相似，表游戏预感到有什么重要的事情即将发生。

晚上十点，海马受邀来到童实野美术馆举行的埃及展览从此社长成为再也没有穿过校服的“学生” ，伊西丝带领他参观了记载着魔法与巫术卡的起源的石板，告诉了卡片之父帕加索斯的灵感来源社长：我选择相信科学但其实是最不科学的一个。伊西丝希望海马在古鲁斯（GHOULS）（“古鲁斯”是传说中挖掘坟墓偷吃尸体的怪物）行动前找到石板上记载的三张罕贵卡——代表善与恶的奥西里斯之天空龙，代表光明与黑暗的欧贝利斯克之巨神兵，代表天与地的太阳神之翼神龙，同时希望他来结束持续到现在共有三千年的第十八代古埃及法老和神官的宿命战争。

但法老王的名字被抹去，也没有任何相关的记载。伊西丝送给了海马目前唯一找到了的欧贝利斯克之巨神兵而且还是英文的来帮助他战斗。

DM动画中添加了一段古代战斗的想象剧情，坐在回去的车上社长声优津田健次郎的狂笑给观众留下了异常深刻的印象。

第二天白天，即将出院的游戏在天台上和暗游戏聊天，暗游戏向表游戏不顾一切地保护积木表示感谢，表游戏回想起暗貘良说过——被千年积木选中的人要担负起寻找无名的法老王失去的记忆的责任。暗游戏表示自己的确对自己的事情一无所知，只知道当表游戏佩戴积木时自己才得以存在。表游戏不再愿意继续这个悲伤的话题，提出出院找城之内决斗，暗游戏在其身后自语道：“可是...我想永远和你在一起......即使我不能恢复记忆......”

表游戏也含泪表示：“我也......我也想一直......我把我的记忆全部都给你！”

DM动画版里这一段独白（告白）改为夜晚在游戏自己家中，以配合前面社长剧情的时间。由于氛围烘托和王样面部小细节做得非常到位，成为DM动画里的经典虐心片段之一。

得到了新卡的海马迫不及待地使用海马集团新开发的决斗盘实验，

在模拟AI喜闻乐见地召唤出了三只青眼白龙后，海马使用欧贝利斯克之巨神兵将其击败。另一方面，按照暗游戏的银☆饰喜好精心打扮后的表游戏约着和杏子见面并且在见面后迅速转化为了暗游戏，在看过杏子出色的即兴舞蹈以及倾听了她对未来的看法后，暗游戏不再对自己未知归宿感到迷茫，下定决心前往了举办埃及展览的童实野美术馆探寻自己的过去。在看到了那块同样的石板后明白了自己身份记忆缺失的原因，为了找回自己的记忆，也开始加入到寻找“三幻神”卡片的行列。

海马为了取得真正的“决斗王”的称号，海马集团在童实野市举办了“决斗都市”大赛，游戏和城之内也一同参加。暗游戏在比赛中击败了使用盗版艾克佐迪亚的古鲁斯以及同样使用黑魔术师系列卡片的敌人潘多拉，随后与马利克远程操控的人偶决斗夺得了奥西里斯之天空龙。

（最早的卡组破坏战术，取胜关键在于洗脑导致的cobom，“内奸龙”名号从此开始。）

城之内克也不慎被马利克控制，以性命要挟暗游戏进行决斗。表游戏不忍心看到朋友们的自相残杀，主动更换意识，并把积木挂在城之内的脖子上干扰千年锡杖的控制，并愿意牺牲自己让城之内获胜，最后在表游戏“城之内君，我最喜欢你了。”的呼唤中清醒，从海马那里拿到钥匙，解救了游戏。

DM动画中改动了剧情：川井静香（城之内克也双眼失明的妹妹）在这段决斗中恢复了视力并拿着钥匙跳入水中将城之内救了上来。

成功晋级八强的游戏和城之内迎来了在海马集团飞艇上的决斗 ，暗游戏使用新得到的欧西里斯之天空龙将暗貘良击败晋级四强，此时马利克已经被千年锡杖的黑暗人格占据身体，变得更加残暴嗜杀，并且可以比表人格更加熟练灵活地使用太阳神之翼神龙，用“黑暗游戏”囚禁了八强战的孔雀舞和四强战的城之内克也。四强战中打败了海马的暗游戏接手了他的欧贝利斯克之巨神兵和打倒太阳神之翼神龙的关键魔法卡恶魔的神域。暗游戏和暗马利克的最终战役是赌上表人格的“黑暗游戏”，最终凝结着同伴们的意志和伙伴的鼓励的卡片回应了暗游戏，成功战胜了暗马利克并抹杀了马利克黑暗人格的存在，终于集齐了“三幻神”卡片。

DM动画将这一段拆分，中间增加了动画原创的“乃亚篇”。这一段结束后，又原创了“多玛篇”和“KC杯决斗大赛篇”。

某天暗游戏遇到自称是夏迪派来的使者——波巴沙，在指引下进入了自己曾经的记忆和“黑暗大神官“阿克纳帝的记忆一并组成的“王之记忆”的世界，与暗貘良展开了最后的战斗。想要帮助“另一个我”的表游戏也和同伴进入了这个世界。暗游戏作为法老王与作为盗贼王的暗貘良激战中快要胜利时，被大邪神的沙漏影响，时间倒流而落败。

索克大邪神在盗贼王的帮助下终于复活，一众神官和年轻的法老王使出全力都没法阻止他的进攻。另一方面，表游戏和伙伴在记忆世界的陵墓中找寻暗游戏的真名的线索，却被早已在陵墓中潜伏的暗貘良偷袭，表游戏为了保护同伴和“另一个我”，和暗貘良展开决斗。被逼入绝境的表游戏终于展现了自己的隐藏实力（“沉默系列”卡组的第一次出场）反败为胜，彻底消灭了寄居在千年智慧轮中的邪恶人格。拿到了暗游戏真名的名牌的众人前往战场，告知了他的真实名字——“阿图姆”，阿图姆也将三幻神的力量合并，召唤出了“光之创造神 哈拉克提”，终于消灭了索克大邪神，取得了最终的胜利。

DM动画版的“埃及篇”因为部分作画监督的离开（其中就有加加美高浩（大神）），作画水准大幅度下降，以及井上善胜（井上大邪神）的著名崩坏（神の200回），让“埃及篇”成为了不少观众的遗憾。

伊西丝和马利克告诉阿图姆，他的灵魂归宿需要在集齐了所有七个千年神器后的冥界之门前举行决斗仪式背后灵和主角的虐心传统的开始后，由冥界之门来判断。最后的决斗对手是自己一直以来最亲密的伙伴——武藤游戏。两人拼上自己全部的力量来战斗，最后阿图姆企图使用魔法卡死者苏生来复活奥西里斯天空龙准备结束战斗时，表游戏使用了之前使用的魔法卡封印之黄金柜的效果——无效其中封印的卡片效果，而黄金柜中封印的正是死者苏生。

阿图姆高度认可了表游戏的成长和他教会自己的东西，

与众人告别后走进了冥界的大门，

回到了昔日同伴们的身边。

随着冥界之门的关闭，七个千年神器再次坠入地下，武藤游戏也找到了自己闪亮的价值，看着地平线冉冉升起的太阳，说出了“这并不是个特别的法老王的故事，每个人都有自己的故事，这是在光中完结的物语。然后——我的故事也才刚刚开始。”后和朋友们回到了童实野市，开始了新的故事。

DM动画中阿图姆把“三幻神”全部召唤了出来，但AIBO使用魔法卡磁石之力反弹了天空龙的效果，三幻神也全被天空龙的效果破坏内奸龙再次名震江湖！AIBO的“沉默系列”卡组漫画里的初始等级和动画里不同，但不影响这套卡组一战成名，在20周年的纪念剧场版上映时也被重制发售。

漫画后接《The Dark Side of Dimensions》（因为决斗之仪时海马不在），DM后接GX。