Nature Food

图2：基于SNP变异构建的51份彩色大米物种发生树和主成分分析。主成分分析图中的黑色字体为黑米种质，红色字体为红米种质。

研究人员后续对63份彩色大米种质进行代谢组和离子组的测定及分析（图3），共鉴定到了625种代谢物和22种金属离子。研究人员发现在黑米中有相对更多的芳香族代谢物和脂质积累，棕米中则有更多的微量元素积累，如锌，铜，硒离子等。

虽然彩色大米有营养元素优势，但是生育期长，产量低是农户不愿意种植的主要原因，因此，研究人员在研究中选择了Cempo Ireng这一棕色大米种质进行了生育期改良实验探索。首先他们建立了基于Cempo Ireng基因型的遗传转化体系（图4），通过比较基因组选择了Cempo Ireng基因组中Hd2，Hd4和Hd5这三个花期的负调控因子进行CRISPR-Cas9基因编辑，成功创制了早花的彩色大米种质（图5）。

以上的工作组装了基因组，建立新的遗传转化体系，创制了全新的育种种质，对于育种家和农户而言，都是非常重要资源。

图3. 彩色大米种质的非靶向代谢组分析

图4. 基于Cempo Ireng种质的遗传转化体系

图5. CRISPR-Cas9编辑Cempo Ireng种质的Hd2，Hd4和Hd5基因可以促进早花

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