只有基因名，能做什么富集分析？

对于我这样的小白来说，芯片和转录组数据最常见的做法的取表达矩阵做差异分析获得logFC,标识change后取DEG再进行富集分析，但是随着学习的深入，还会有相关基因或其他目标基因需要进行富集分析，此时即使只有感兴趣的基因名，也是能做ORA富集分析的。

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ORA富集分析 (qq.com)

ORA分析通俗来说就是将获得的基因与所选择的数据库中的通路进行比对，计算输入的基因在通路基因中的比例。

通常会得到GenRatio(属于该通路的输入基因个数M/在数据库中的输入基因个数N)和BgRatio(该通路的所有基因a/收集在数据库中的所有通路基因b)。

可以看作在有b个基因的数据库(含有a个x通路基因)的暗箱中进行N次不放回的抽取，获得了M个属于x通路的基因（超几何模型：不放回的抽取）。

然后通过假设检验的方式来确定来判断我们选择的基因和通路是否有关系，假设检验的步骤如下：

设立H0：输入的基因与某通路无关。

在H0成立的前提下，计算获得我们的抽取结果的概率p，若p