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【菌周刊】菌种建库篇|大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备

2023-12-25 05:26| 来源: 网络整理| 查看: 265

大肠杆菌是人和许多动物肠道中最主要且数量最多的一种细菌,具有由肽聚糖组成的细胞壁,仅有拟核,细胞质中的质粒常用作基因工程中的运载体。因其拥有全基因组测序的优势,基因克隆表达系统成熟完善,被美国FDA批准为安全的基因工程受体生物。

在大肠杆菌中有许多感受态细胞,是受体细胞经过特殊方法处理后,细胞膜的通透性发生改变,从而允许外源DNA的载体分子通过的细胞。接下来我们了解一些关于大肠杆菌DH5α感受态细胞的原理和制备过程。

感受态细胞

在大肠杆菌感受态制备和转化过程中,Ca2+使得细菌细胞膜发生了一系列变化,从而极大增加了外源质粒进入细胞内部的机率。处于这样一种状态的细菌细胞,就称之为“感受态”细胞。

感受态细胞的制备和转化是分子生物学实验中频繁使用的重要操作,最早的大肠杆菌感受态细胞制备的方法是Cohen等人于1972年建立的,该方法的主要原理是细菌通过冰冷的CaCl2低渗溶液处理后,加入待转化质粒DNA,经42 ℃短时间热冲击,细菌细胞可增加对该质粒DNA的摄入,该法已成为目前实验室制备感受态细胞的常规实验方法。

图1 CaCl2法制备感受态细胞

DH5α菌株

DH5α常用于质粒克隆。E. coli DH5α在使用pUC系列质粒载体转化时,可与载体编码的β-半乳糖苷酶氨基端实现α-互补,可用于蓝白斑筛选鉴别重组菌株。recA1和endA1的突变有利于克隆DNA的稳定和高纯度质粒DNA的提取,因此,作为工程菌常用于分子克隆、质粒提取。

 图2 DH5α用于蓝白斑筛选鉴别重组菌株

星耀小TIP:

1、因为有些载体都带有一个LacZ基因的调控序列和头146个氨基酸的编码信息,编码α-互补肽,该肽段能与宿主编码的缺陷型β-半乳糖苷酶实现基因内互补(α-互补)。当这种载体转入可编码β-半乳糖苷酶C端部分序列的宿主细胞中时,在异丙基-β-D硫代半乳糖苷(IPTG)的诱导下,宿主可同时合成这两种肽段,虽然它们各自都没有酶活性,但它们可以融为一体形成具有酶活性的蛋白质。所以称这种现象为a-互补现象。

2、由互补产生的β-半乳糖苷酶(LacZ)能够作用于生色底物5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷(X-gal)而产生蓝色的菌落,所以利用这个特点,在载体的该基因编码序列之间人工放入个多克隆位点,当插入一个外源DNA片段时,会造成LacZ(α)基因的失活,破坏α-互补作用,就不能产生具有活性的酶。所以,有重组质粒的菌落为白色,而没有重组质粒的菌落为蓝色。

图3  质粒基因片段的重组流程

对细菌而言,为达到高效转化,活细胞数务必少于108细胞/mL。对于大多数E.coli来说,相当于OD600为0.4左右,但由于转化是一个很复杂的过程,具体的作用机理仍在探究中。有文献指出,细菌的最佳感受态细胞制备期对于不同菌株是不同的,并不一定都是在活细胞浓度为 108 细胞/mL的时候最适宜,故针对所使用的菌株确定其最佳转化条件仍有必要。

DH5α菌株是一种经诱变的菌株,其基本特性是:Rˉ、Mˉ、AMPˉ。Mˉ指DH5α菌株缺乏DNA修饰,即其自身DNA不会被修饰。Rˉ指其缺乏“免疫”机制,不会对导入的外源DNA切割。AMPˉ指其对氨苄青霉素敏感。DH5α菌株可以用于制作基因库等,除此之外,因其特性,可用作基因工程的受体菌,在用作工程菌时常被用于质粒克隆和原核表达研究。

图4 大肠杆菌DH5α结构示意图

大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备过程

CaCl2法是目前使用较多的大肠杆菌制备方法。通过CaCl2处理受体菌,就可以使大肠杆菌细胞具备接受外援DNA的能力。在CaCl2处理和制备大肠杆菌感受态细胞的过程中,Ca2+是感受态建立和转化的必要条件。Ca2+的作用,就是与细菌细胞膜上的多聚无机磷酸和多聚羟基丁酸化合物形成抗DNA酶(DNase)的羟基-磷酸钙复合物,并黏附在细菌细胞膜的外表面上,破坏细菌细胞膜上的脂质阵列,从而方便外源DNA的渗入。CaCl2法制备大肠杆菌感受态细胞,操作简便,同时转化率也比较高,可以达到5×10~2×10转化子/微克质粒DNA。如何使用CaCl2法来制备感受态细胞呢?接下来我们浅谈一下DH5α菌株的制备方法。

制备方法:

制备方法参照《Molecular Cloning》所介绍的CaCl2法。

1、从37 ℃培养过夜的新鲜平板中挑DH5α单菌落,接种到 5 mL LB培养基中,37 ℃下270 r /min震荡培养过夜;

2、取2 mL过夜培养菌液注入到 100 mL LB培养基中,37℃下激烈震荡培养至A600=0.4~0.6(约2h);

3、将培养液转移到灭菌过的50 mL离心管中,在冰上放置 10 min; 4℃下4000 r/min离心10 min,弃上清回收菌体;

4、倒置离心管并用无菌滤纸尽可能吸干上清培养液,用50mL预冷的无菌0.1 mol/L CaCl2溶液重新悬浮每份细菌沉淀,冰浴30~60 min;

5、再次于4 ℃下4000 r/min离心10 min,弃上清并用无菌滤纸尽可能吸干上清液;

6、用10 mL预冷的无菌0.1 mol/L CaCl2溶液再次悬浮每份细菌沉淀,每份100 uL分装。

星耀小TIP:

1、   作为基因工程和分子生物学研究中常用的技术,大肠杆菌感受态细胞的转化方法目前主要有氯化钙法、醋酸锂法、电激法等多种手段,而氯化钙法由于操作简单,成本较低,因此在常规实验中应用最为广泛。

2、   CaCl2法所制备的大肠杆菌感受态细胞,往往对于温度和保存时间有较高的要求,转化率也受到诸多因素影响。因此,在实际实验中需要对新鲜处理的感受态细胞进行复杂的甘油、液氮处理及超低温保存,过多的样品处理环节就需要购置昂贵的超低温设备,增加实验成本,延迟操作时间,也会增加转化污染的可能。

3、   大多数分子生物学和基因工程常规实验,例如DNA测序、载体构建等,往往对于感受态细胞的转化率要求并不是非常高。每个平板中有一百个以上的成功转化子,足以支持实验需求。但这些繁琐的重复性实验,则对实验的简便性要求较高。

DH5α在生物工程中的具体应用

质粒pGEM在DH5α感受态细胞内的转化研究

绿色荧光蛋白(Green Fluorescent Protein,GFP)是源于海洋生物多管水母属(aequoia victoria)的一种发光蛋白,由约238个氨基酸组成,能够自身催化形成生色团并在蓝光激发下发出绿色荧光,可在活细胞内稳定表达。在细胞生物学与分子生物学中,绿色荧光蛋白(GFP)能在不同的细胞内稳定表达,无种属、组织和位置特异性,对细胞无毒性且检测方法简单,故常用做报告基因(reporter gene)。通过基因工程技术,绿色荧光蛋白(GFP)基因能转进不同物种的基因组,在后代中持续表达。目前绿色荧光蛋白(GFP)基因已被导入并表达在许多物种,包括细菌、酵母和其他真菌的细胞。

图5 绿色荧光蛋白结构图解

我们从含GFP的大肠杆菌中提取质粒,利用胶回收试剂盒纯化质粒后,采用CaCl2法将工程菌DH5α制成感受态细胞,然后将纯化后的质粒转入已制备好的感受态细胞中,使得工程菌DH5α转化成具有抗氨苄青霉素的大肠杆菌,并表达绿色荧光蛋白,接种于加氨苄青霉素的LB培养基上,来筛选阳性克隆。

质粒pGEM是一长度为4.7 kb的环形DNA,在其序列中有一编码绿色荧光蛋白的基因,结构中有来自大肠杆菌T7及T3噬菌体的强启动子下游装置多克隆位点,组建成质粒载体(pGEM)就有可能合成高比活度的单链DNA探针。

图6 pGEM T7结构示意图

在此篇文章中,我们主要讲述实验室中质粒pGEM在DH5α感受态细胞内的转化研究方法。

实验流程:

1、 GFP质粒 DNA的大剂量制备

往1L烧瓶中加入500 ml含有适当抗生素(氨苄青霉素)的LB培养基,然后加入5 ml过夜培养的带有所需质粒的大肠杆菌( GFP)培养物,再于37℃摇床培养至饱和状态;

于4℃环境中,6000 g 离心10 min ,倒掉上清液;

用4 ml GTE溶液重悬沉淀并转移到一个容积为50ml的高速离心管中;

加入 1 ml新配制的含20 mg/ml溶菌酶的GTE 溶液重悬沉淀,于室温放置10min。

加入 10 ml新配的 NaOH/SDS 溶液,并轻轻混匀直至液体变得均一、清亮而且粘稠,并于冰上放置10 min;

加入7.5 g 乙酸钾溶液,用吸管轻轻搅拌直至粘稠度下降并形成大的沉淀,于冰上放置10min,于4 ℃ 20000 g 离心10 min,将上清液轻轻倒入至另一干净的离心管中;

加入0.6倍体积的异丙醇颠倒混匀,室温放置5~10 min。于室温1500 g离心10 min;

加入2 ml 70%乙醇轻轻洗涤沉淀,然后12000 r/min离心 5 min,吸去乙醇,并真空干燥,最后凝胶电泳检测结果。

2、 快速胶回收质粒DNA

上样电泳,切下目的条带,胶块尽量小;

按100 µl胶块加700µl溶胶液的比例,室温溶胶(或55℃溶胶),其间偶尔摇动,装柱,9000 r/min离心30 s,去掉废液;

500µl漂洗液漂洗,12000 r/min离心30 s;

重复漂洗1次;

倒掉废液后﹐再于12000 r/min离心2 min;

在柱子中加入合适体积的洗脱缓冲液(通常30~50 µl)12000 r/min离心洗脱。

3、 质粒pGEM 的转化

用冷却的无菌吸头从每种感受态细胞悬液中各取200 µl转移到无菌的微量离心管中,每管加质粒pGEM(体积≤10 µl,DNA≤50 mg),轻轻旋动以混匀内容物,在冰中放置30 min;

将管放到预加温到42℃水浴中90 s,不要摇动试管。快速将管转移到冰浴中,使细胞冷却1~2 min;

每管加800 µl LB培养基,水浴加温到37℃,然后37 ℃摇床60 r/min(温和摇动),温育45 min使细胞复苏;

将适当体积已转化的感受态细胞接种于含50 µg/ml氨苄青霉素的LB 上。在3个加抗生素的平板上分别加入100、200 、300 µl并涂平,在加抗生素的平板上接种DH5α,然后再在无抗生素的平板上加100 µl感受态细胞液,作为空白对照;

将平板置于室温直至液体被吸收;

倒置平板于37℃培养12~16 h。

总结

在提取并纯化了质粒pGEM的基础上,通过实验图解可以看出,采用氯化钙法制备的感受态细胞活性良好,通过转化自制的质粒,获得了大量阳性克隆,转化后的菌体有了抗抗生素功能而且绿色荧光蛋白表达正常。

图7 质粒pGEM抗生素筛选结果图

图8 阳性克隆结果

耀海生物

 由上述实验可知,DH5α不仅是实验室中常用的菌株,还广泛应用于工艺生产中。耀海生物目前科研级mRNA平台的预制品——增强型绿色荧光蛋白(eGFP)已问世。增强型绿色荧光蛋白(eGFP)是 GFP的突变体,发射出的荧光强度比GFP大6倍以上,是一种比GFP更适合用来研究基因表达、调控、细胞分化及蛋白质在生物体内定位和转运等基因工程的报告基因。耀海生物搭建科研级mRNA平台提供预制品:在创新药蓬勃发展的大环境下,耀海生物搭建了“RNASci”mRNA科研级样品制备服务平台。基于酶法加帽和共转录加帽,耀海生物现已推出自主开发设计的科研级预制品mRNA-eGFP(增强绿色荧光蛋白)。

图9  mRNA-eGFP(共转录加帽法)图10  mRNA-eGFP(酶法加帽)

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大肠杆菌是实验室常用的菌种,人们对其细胞形态及生理生化特性已经了解得比较深入,对于培养基配制与运载体导入的具体技术等方面也更容易把握。耀海生物在原核生物上选择大肠杆菌为表达体系,DH5α更是耀海工艺生产中常用的感受态细胞。耀海生物拥有制定最适合菌种以及表达物的质量标准,确保质量标准的有效性及权威性的能力,且重视客户意见,会根据客户的需求以及条件,建立并交付整套质量标准以及检测方法。

参考文献:

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