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微生物多样性测序分析及环境,土壤微生物分析

2023-08-19 13:21| 来源: 网络整理| 查看: 265

成功案例展示 案例一

Degradation of polyethylene plastic in soil and effects on microbial community composition

发表时间:2021

合作单位:西北农林科技大学

发表期刊: Journal of Hazardous Materials

研究背景:全球土壤系统中的塑料污染正成为一个严重的全球性问题,对陆地生态系统服务和人类健康构成潜在威胁。为了确定聚乙烯薄膜的降解性和生态效应,本研究以小麦为试材,通过盆栽试验,研究塑料降解与土壤微生物群落组成之间的相互作用。

测序策略: 16S V3+V4 Illumina Hiseq 2500 PE250

研究结论:不同条件下的PE膜具有独特的降解性能,改变了土壤微生物群落组成。此外,在塑料薄膜上形成了一个巨大的独特的微生物群,这可能会改变土壤的基本性质。PE膜可能是一种独特的微生物定殖基质,可能促进其自身降解,改变生物地球化学过程和土壤生态功能。

参考文献: Daofen Huang, Yibo Xu, Fadan Lei, Xiaoqin Yu, Zhuozhi Ouyang, Yanhua Chen, Hanzhong Jia, Xuetao Guo,Degradation of polyethylene plastic in soil and effects on microbial community composition,Journal of Hazardous Materials,2021

1不同条件下微生物群落中共有和特有OTUs的维恩图2不同条件下微生物群落结构三元相图3不同条件下微生物门水平相对丰度 案例二

Nitrogen removal mechanism of marine anammox bacteria treating nitrogen-laden saline wastewater in response to ultraviolet (UV) irradiation: High UV tolerance and microbial community shift

发表时间:2021

合作单位:青岛大学

发表期刊: Bioresource Technology

研究背景:海洋厌氧氨氧化菌(MAB)可以自然克服盐胁迫,但其生长速率低、对操作条件敏感仍是应用厌氧氨氧化的挑战。为增强MAB的富集,深入了解紫外线辐照与MAB的关系,将紫外线引入MAB脱氮工艺中,研究MAB在不同紫外线剂量下处理含氮含盐废水的脱氮机理,分析不同紫外线剂量引起的胞外多聚物(EPS)含量、关键酶活性和微生物群落组成及紫外线照射下微生物预测功能的动态探讨。

测序策略: 16S V3+V4 Illumina Hiseq 2500 PE250

研究结论:在处理含氮盐渍废水中,念珠菌对UV-C辐照的耐受性较高,可达12000 mJ/cm2。在此剂量下,微生物丰富度增加,多样性降低,MAB的相对丰度提高了1.2倍。过量的EPS产量和厌氧氨氧化菌的特殊结构是维持紫外辐射下厌氧氨氧化活性的两条防线。

参考文献: Yuanyuan Gao, Jin Li, Huiyu Dong, Zhimin Qiang,Nitrogen removal mechanism of marine anammox bacteria treating nitrogen-laden saline wastewater in response to ultraviolet (UV) irradiation: High UV tolerance and microbial community shift,Bioresource Technology,2021

4实验设计5门水平微生物群落结构6KEGG数据库微生物功能预测分析


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