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在线绘制基因染色体位置图

2024-07-09 20:13| 来源: 网络整理| 查看: 265

之前我们在 绘制基因染色体位置图 这篇文章里介绍了Mapchart软件绘制基因染色体位置图。今天再介绍一个可以绘制染色体位置图的在线网站——MapGene2Chrom。网站地址:http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.1/。

输入文件准备

绘制染色体位置图需要准备两个文件:基因位置文件和染色体长度文件。基因位置文件格式如下:

AT1G06180.1    1889408 1891158 Chr1    AT1G08810.1    2819065 2820395 Chr1    AT1G08810.2    2819068 2820020 Chr1    AT1G09540.1    3086159 3087912 Chr1    blueAT1G09770.1    3161841 3165360 Chr1    red

第一列为基因ID;第二列为基因起始位置;第三列为基因终止位置;第四列为;基因所属染色体名称;第五列为设置基因的颜色。染色体长度文件格式如下:

Chr1    30427671Chr2    19698289Chr3    23459830Chr4    18585056Chr5    26975502

第一列为染色体名称;第二列为染色体长度。

绘图

准备好输入文件后即可打开MapGene2Chrom网站绘制图片了。将基因位置信息和染色体长度信息分别输入对应的文本框中,点击 “DRAW” 绘图,生成图片如下。

attachments-2021-11-roD7qPO6618e17e67900b.png

网站左侧还可以设置一些参数,对图片进行修改:

attachments-2021-11-dYvYoM8s618e182ddeee0.png

如设置染色体名称的字体、大小和颜色,染色体的宽高以及颜色,基因名称的字体大小及显示方式等。大家可以试着设置一下,绘制自己需要的图片,小编这里就不细讲了。绘制好图片后即可下载需要的图片格式。

attachments-2021-11-DmbnvZ6E618e184017f21.png

好了,今天就到这里,大家操作一下试试吧,下期再见!

此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下:

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