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单样本官方分析流程：
https://www.jianshu.com/p/2314a472317f
注释网站cellMarker:
http://xteam.xbio.top/CellMarker/search.jsp?cellMarkerSpeciesType=Mouse&cellMarker=CD14
https://panglaodb.se/markers.html?cell_type=%27Pulmonary%20alveolar%20type%20I%20cells%27
单细胞测序数据拆分
https://www.jianshu.com/p/56c550557a9f
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关于单细胞的文件：
matrix文件：
第一行，第一个字段表示基因的类别数，第二个字段代表细胞的个数，第三列代表所有细胞所有基因的总表达量
第一列代表基因编号，比如67号基因
第二列是细胞编号：比如1，代表1号细胞，有独立的barcode；
第三列代表基因的表达量
如果遇到格式和上面对不上的需要自行修改
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记住用conda安装R和R包（centOS系统要用这个安装最快最简单！）
https://blog.csdn.net/x_yAOTU/article/details/126141223
永远选择最简单有效的方法完成任务！
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常用的分析流程：
#####chongzuo chongzuo chongzuo########
#setwd('F://danxibaofenxi20230529//GSE151674//analysis//redo230606/')
setwd('F://danxibaofenxi20230529//GSE151674//analysis//674redo20230607')
setwd('F://danxibaofenxi20230529//GSE136831//analysis')
#BiocManager::install('SoupX')
#library(SoupX)
#rm(list=ls())
library(dplyr)
#install.packages('dplyr')
library(Seurat)
#BiocManager::install('lazyeval')
library(patchwork)
## =============1.Load the PBMC dataset
data_dir |