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打开工程窗口化Thresholding 二值化Region growing区域增长创建一个3D表示,并显示股骨头从髋臼中区分出来,并单独为股骨头建立3D模型
CT图像的形态学操作STL+过程 STL+ 生成
打开工程 Opening the Project窗口化 Windowing二值化 Thresholding区域增长 Region Growing建立 3D 表示 Creating a 3D representation显示 3D 表示 Displaying a 3D representationCT图像的形态学操作STL+过程 STL+ Procedures生成 STL 文件 Generating a STL file
打开工程
如,我们打开一个MedData中给的心脏的CT图片 首先,我们必须把不同视图中的图片对比度调整到一个合适的值。对比度的增强,有助于选择不同密度的部分,例如骨头和脑肿瘤,这个操作可以在任何时候做,可以在工程管理器的对比度标签中改变。 VIEW > Bottom PanelSEGMENT > Threshold 二值化保留分割对象的图片中灰度值大于或等于阈值的像素,有时需要定义阈值的上界(min)和下界(max),分割掩膜将保留所有灰度值在上下界之间的像素。例如,比较小的阈值选择病人的软组织比较容易,阈值比较大则只会保留比较稠密的部分。定义上界和下界阈值选择神经部分就比较容易。如何定义一个好的阈值取决于建模的目的:如果你想要一个好看的模型,建议使用比较小的阈值,因为这样建出的模型洞比较少;相反,如果是为了建立义肢的模型服务的话就推荐使用比较大的阈值。如,我们换个部位,股骨颈部位的CT:
区域增长工具能够将二值化得到的分割分成几块,同时去除漂浮像素。 见后面的髋臼分离出股骨头的例子。 创建一个3D表示,并显示在掩膜标签中你能够看到所有之前创建的掩膜以及他们各自的阈值,这些掩膜的名字是Green (如果新建了mask还会有Yellow和blue等),被选中的掩膜则为 active 的,同时可以重命名掩膜,方法为:如,单击 Green 为可编辑状态,输入新名字即可。 右键单击空白 > Calculate Part…
体积渲染:点击“体积渲染”,将原来的绿色设为不显示,就能看到内部体积渲染的结果。 Show / Hide triangles 由于分割的最终结果成功与否与CT图像的分辨率大小有关,有些分辨率不太够的可能会导致某些区域的边界处会有细微的相连导致分割失败,一种方法就是利用Edit Masks手动处理那些相对细微的连接区域,擦除一些边界处细微的连接区域,然后利用区域增长Region Grow进行区域的分割,得到股骨头和髋臼的分离结果。 【Edit Masks】 【区域增长菜单栏】 提示:在区域增长之前必须进行二值化,因为二值化以后所有之前做的工作都没掉了。 【注】 在处理之前,最好通过Duplicate Mask来复制一份初始的mask,因为区域增长操作后,这些二值化的结果就发生变化了,要在处理之前备份一下。 【分割结果】 采用3D视角,再点击进行Edit Masks操作,就能直接在3D模型上进行处理 这里学过数字图像处理的小伙伴就很熟悉了,图像的形态学操作包括腐蚀(Erode)、膨胀(Dilate)、开运算(Open)、闭运算(Close) IMAGE > Morphology operations STL文件(STereo Lithography),一种为快速原型制造技术服务的三维图形文件格式。 在 Mimics 和 STL+之间的中间文件格式可以为以下几种: “.3dd”文件掩膜3D 对象FILE > Export > Binary STL / ASCII STL |
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