TCMSP数据库

参考文献： Ru, J.; Li, P.; Wang, J.; Zhou, W.; Li, B.; Huang, C.; Li, P.; Guo, Z.; Tao, W.; Yang, Y.; et al. TCMSP: a database of systems pharmacology for drug discovery from herbal medicines. J Cheminform 2014, 6, 13, doi:10.1186/1758-2946-6-13.

(1) Com- pounds, targets and diseases information (Figure 1 B1, B2 and B3); (2) Herbal ingredients with their ADME-re- lated properties (Figure 1 C1); (3) Compounds-Targets relationships (Figure 1 C2) and Targets-Diseases rela- tionships (Figure 1 C3).

其中成分信息界面内的基本信息包括几种

其中具体的成分界面有以下信息显示

1）mol ID 药物在TCMSP中定义的ID信息，如 MOL011038； 2）molecule name，分子名称，如(+)-Catechin-5-O-glucoside； 3）MW，molecule weight，相对分子量； 4）AlogP，脂水分配系数的对数值； 5）氢键供体donor； 6）氢键受体acceptor； 7）OB%，oral bioavailability 口服生物利用度； 8）Caco-2渗透率，及肠上皮通透性； 9）BBB，血脑屏障； 10）DL，drug-likeness； 11）FASA-，Fractional water accessible surface area of all atoms with negative partial charge，一般作为类药性评价的标准之一； 12）TPSA，描述的是化合物极性； 13）RBN，化合物中可旋转键的个数； 14）HL，药物半衰期；

补充一下Lipinski’s rule of five（利平斯基五倍率法则）： 评估一个药物能否成药，或者一个具有药理学活性或生物学活性的化合物能否成为口服药物的经验法则。

包括： 1.化合物的分子量不大于500道尔顿； 2.化合物结构中的氢键供体（包括羟基、氨基等）的数量不大于5个； 3.化合物中氢键受体的数量不大于10个； 4.化合物的脂水分配系数的对数值 （logP）不大于5； 5.化合物中可旋转键的数量不大于10个。

官网也提供了一个药物的筛选标准：