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MIMIC-III 临床数据集V1.4简介
Reference：MIMIC-III数据集介绍 TIME：06/06/2023 数据库介绍MIMIC-III(重症监护医学信息市场)是一个大型的单中心数据库，其中包含与大型三级护理医院重症监护病房收治的患者有关的信息 数据包括生命体征，药物，实验室测量值，医嘱，手术代码，诊断代码，影像报告，住院时间，生存数据等 MIMIC-III包含与2001年至2012年之间进入重症监护病房的成年患者(16岁或以上）的53,423例不同的医院入院相关的数据以及2001年至2008年之间收治的7870名新生儿的数据 数据集中一共包括26个数据表，除了字典表（D_开头）以外，表之间通过患者编号（SUBJECT_ID）、病案号（HADM_ID）、和ICU编号（ICUSTAY_ID）连接 按照数据格式，患者数据可以被划分为结构化数据（实验室测量、生命体征等）和非结构化数据（医嘱信息等） 一个患者对应一个subject_id,但是可能多次入院,有多个hadm_id,一次入院可能有多次进入ICU,即一个hadm_id可能对应多个icustay_id 通常采用一个hadm_id对应的第一个icustay_id开展相关的研究 字典表用于某个项的查询,举例如下: 比如查询某个患者的白细胞的数据(在LABEVENTS表中),首先需要找到患者对应的三个ID,然后在实验室检查编码(d_labitems)中找到白细胞的item_id,然后再去LABEVENTS表中查找 官方数据说明MIMIC-III 是一个包含 26 个表的关系数据库。表由通常带有后缀“ID”的标识符链接。例如，SUBJECT_ID 指的是唯一的患者，HADM_ID 指的是唯一的医院入院，ICUSTAY_ID 指的是唯一的重症监护病房入院。 记录、实验室测试和体液平衡等图表事件存储在一系列“events”表中。例如，OUTPUTEVENTS 表包含与给定患者的输出相关的所有测量值，而 LABEVENTS 表包含患者的实验室测试结果。 以“D_”为前缀的表是字典表，并提供标识符的定义。例如，CHARTEVENTS 的每一行都与一个 ITEMID 相关联，它表示测量的概念，但它不包含测量的实际名称。通过在 ITEMID 上连接 CHARTEVENTS 和 D_ITEMS，可以识别给定 ITEMID 所代表的概念。 开发 MIMIC 数据模型涉及平衡解释的简单性和与基本事实的接近程度。因此，该模型反映了基础数据源，根据用户反馈对 MIMIC 数据库的迭代进行了修改。在进行转换时已注意避免对基础数据做出假设，因此 MIMIC-III 密切代表原始医院数据。 从广义上讲，有五个表格用于定义和跟踪患者住院时间： ADMISSIONS；（入院） PATIENTS; （患者） ICUSTAYS；（ICU） SERVICES; （服务） TRANSFERS. （转移） 另外五个表是对照各自定义交叉引用代码的字典： D_CPT； D_ICD_DIAGNOSES； D_ICD_PROCEDURES； D_ITEMS； D_LABITEMS. 其余表包含与患者护理相关的数据，例如生理测量、护理人员观察和账单信息。 在某些情况下，可以合并表——例如，D_ICD_PROCEDURES 和 CPTEVENTS 表都包含与程序相关的详细信息并且可以合并——但我们的方法是为了清楚起见保持表独立，因为数据源明显不同。我们建议研究人员开发适当的数据库视图和转换，而不是在 MIMIC 数据模型中组合表格。 全部26张表的详细信息患者人口学信息以及院内周转信息（6张） 表名简介特征/属性行列数文件大小ADMISSIONS患者入院情况行号、患者编号、病案号、入院时间、出院时间、死亡时间、入院类型、入院地点、出院目的地、保险类型、语种、宗教信仰、婚姻状况、种族、急诊留观登记时间、急诊留观出观时间、初步诊断、院内死亡标记、是否有charievents记录58,976*1912.5MBCALLOUT患者ICU出科时的即时信息行号、患者编号、病案号、提交出科申请的科室代码、目标科室代码、出科申请结果、患者需接受的治疗服务、出科且期、出科时是否感染了MRSA等34,499*246.34MBICUSTAYSICU入住信息行号、患者编号、病案号、ICU病案号、数据源、患者入住监护室24小时内的首个和最终监护室类别、入住首个和末次监护室代码、入科出科时间、住院时长61,532*126.36MBPATIENTS患者信息行号、患者编号、性别、出生日期、死亡日期、院内登记死亡日期、社保局登记死亡日期、死亡标记种类46,520*82.63MBSERVICES患者需要接受的医疗服务行号、患者编号、病案号、服务种类更改时间、前次服务种类、当前服务73,343*63.48MBTRANSFERS患者周转信息行号、患者编号、病案号、ICU病案号、数据源、周转项目、前次和当前所在监护室类型、前次和当前所在科室代码、入科出科时间、住院时长261,897*1325.1MB患者在监护室住院期间采集的各类信息（8张） 表名简介特征/属性行列数文件大小CAREGIVERS护理人员信息行号、护理人员标志符、头衔缩穿、类别7,567*4203KBCHARTEVENTS患者观察记录数据行号、患者编号、病案号、ICU病案号、项目标志符、记录时间、存储时间、护理人员标志符、项目值等330,712,483*1535.5GBDATETIMEEVENTS患者操作时间信息行号、患者编号、病案号、ICU病案号、项目标志符、记录时间、存储时间、护理人员标志符、项目对应时间4,485,937*14526MBINPUTEVENTS_CV使用CareVue监护系统记录的入量信息行号、患者编号、病案号、ICU病案号、记录时间、项目标志符、前次纪录至今总入量、护理人员标志符、给药速率、给药途径、给药部位药品组合标志符、药品组合总量17,527,935*222.46GBINPUTEVENTS_MViMDSoftMetavision系统入量数据行号、患者编号、病案号、ICU病案号、出入量活动开始结束时间、项目标志符、总入量、入量单位、药品组合标志符、药品一级分类名、药品类型、液体总量、出科后是否续药、输液状态等3,618,991*31975MBNOTEEVENTS治疗记录行号、患者编号、病案号、记录时间、记录类别、护理人员标志符、医嘱具体内容2,083,180*114.01GBOUTPUTEVENTS患者出量信息行号、患者编号、病案号、ICU病案号、记录时间,项目标志符、液体出量、护理人员标志符、输液是否中断、新液体准备状态4,349,218*13396MBPROCEDUREEVENTS_MVMetavision系统的操作信息行号、患者编号、病案号、ICU病案号、操作或手术开始结束时间、项目标志符、项目值、数据上传时间、护理人员标志符、药品组合标志符、药品一级分类名、药品类型、医嘱状态258,066*2548.8MB医院记录系统采集的各类信息（7张） 表名简介特征/属性行列数文件大小CPTEVENTS患者操作记录行号、患者编码、病案号、记录时间、操作编码、部门573,146*1258.2MBDIAGNOSES_ICD患者诊断ICD-9编码行号、患者编号、病案号、ICD9编码651,047*519.1MBDRGCODES患者诊断类别组行号、患者编号、病案号、诊断类别、诊断编码125,557*810.5MBLABEVENTS患者化验项目行号、患者编号、病案号、项目标志符、记录时间、项目值27,854,055*91.85GBMICROBIOLOGYEVENTS病人标本微生物病原体检测结界行号、患者编号、病案号、记录时间、化验项目标志符、化验类型、化验微生物、是否隔离631,726*1672.5MBPRESCRIPTIONS病人用药记录行号、患者编号、病案号、ICU病案号、用药开始结束时间、药物类型、药物名称、剂量，用药途径、处方药代码、药物gsn4,156,450*19770MBPROCEDURES_ICD病人手术记录ICD-9编码行号、患者编号、病案号、ICD9编码240,095*56.8MB字典信息（5张） 表名简介特征/属性行列数文件大小D_CPT操作记录代码索引细分成多个category，包括每个子部分的代号及范围134*913.8KBD_ICD_DIAGNOSES诊断代码索引行号、ICD9编码、缩写、全称14,567*41.39MBD_ICD_PROCEDURES手术操作代码索引行号、ICD9编码、缩写、全称3,882*4311KBD_ITEMS记录项目代码索引行号、项目标志符、项目标签、数据来源12,487*10954KBD_LABITEMS化验项目代码索引行号、项目标志符、项目标签、化验类型753*643.1KB 全部26张表总结1、ADMISSIONS患者入院情况，包括每个患者的入院代码、患者标识码、人口统计学资料等 2、CALLOUT患者准备从ICU出科时的即时信息,包括具体ICU科室、病床号、出科日期等 3、CAREGIVERS监护提供人员，是医生、护士还是社工等 4、CHARTEVENTS患者的呼吸机设定、神志状态，患者入院期间的大多数信息都在这个大表里 5、CPTEVENTS患者操作记录 6、D_CPTCPT操作记录代码索引 7、D_ICD_DIAGNOSESICD-9诊断代码索引 8、D_ICD_PROCEDURESICD-9手术操作代码索引 9、D_ITEMS记录项目代码索引，如代码211就是用来表示心率的 10、D_LABITEMS化验项目代码索引，如50820表示血气化验里的pH 11、DATETIMEEVENTS各项操作日期信息 12、DIAGNOSES_ICD患者诊断ICD-9码 13、DRGCODES患者诊断类别组 14、ICUSTAYSICU出入科时间 15、INPUTEVENTS_CV使用CareVue监护系统记录的入量信息 16、INPUTEVENTS_MV使用Metavision监护系统记录的入量信息 17、OUTPUTEVENTS患者出量信息 18、LABEVENTS患者化验项目结果 19、MICROBIOLOGYEVENTS患者标本微生物病原体检测结果 20、NOTEEVENTS病程及出院录记录信息 21、PATIENTS患者出生及死亡信息 22、PRESCRIPTIONS患者用药记录 23、PROCEDUREEVENTS_MV患者手术记录 24、PROCEDURES ICD患者手术记录ICD-9码 25、SERVICES患者在院期间接受专科服务信息 26、TRANSFERS患者在院期间所有床位信息 |
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