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4种必备的科研绘图工具(强烈推荐)

2023-04-06 03:18| 来源: 网络整理| 查看: 265

1.GraphPad Prism如果是刚入科研大门的小白,可以先不上手Origin、SPSS等复杂一点的工具,GraphPad Prism是最适合新手绘图的工具。因为相比其他工具,它不需要输入什么参数(就是计算机可以读懂的语言)来执行绘图功能。而且操作非常简单,比如你需要改每个指标的颜色,你操作的时候就会感觉Prism的每个界面都在引导你到达你想要的目标,根本不需要什么教程。这可能也是我一开始接触科研绘图,老师推荐的第一个工具。

①首先数据和图在页面可以来回切换,就不存在其他工具画着画着数据找不着了。

②柱状图、X-Y图、散点图就非常适合在Prism上绘。每种类型会细分为多种模式,供选择种类多。

Prism适合做柱状图、饼图、X-Y图、盒须图和散点图等。就当这个盒须图来说,我遇到过两组数据高度偏差太大,那么就需要打断其中一组数据,而Prism相对于其他工具来说就显得操作简单些(网上找教程)。缺点:比如在立体图、热图这一些,相比Origin的其他工具,Prism就显得没有优势。

2.OriginOrigin越新的版本功能越多,我用的是Origin Pro 2019版。除Prism外,相比其他科研绘图,我觉得Origin是相对比较简单的而丰富的。例如,它包括二维图、三维图。而且图简单易懂,非常多的SCI论文很容易看出就是使用Origin绘出的图。Origin是每个科研生都知道的一款工具,而且是每个老师都会推荐的。Origin一般是对数据进行直接绘图,如果你要进行数据处理加工可以选择SPSS先处理一下。

Ps:记得有次上公选课(本科),老师就发现我的画的图和其他同学不一样,因为他一眼看出来我是学过Origin的,当时觉得还挺骄傲,比其他同学进步一小步哈哈哈哈。所以入门越早越好,好好把Origin用起来。

①就但这个界面来说,就有11种类型的数据处理方式,一般选择Blank Work 和Assays就足够了。

②比如它的2D图,就相当于在Prism上进行色彩丰富化、类型多样化。Origin可供选择的色彩比Prism多,如果你配图能力训练得很强的话画出来的图非常抓眼。如果你先学会了Prism,那么上手Origin也就很简单了。

③不单单指2D图,还有统计图、箱型图(盒须图)、等高线图、热图和3D图等。而且每种类型都会出现不同样式的排布方式。特别是,我最喜欢用Origin的热图功能,因为它的种类很多,数据可以直接生成热图,即出即用。基本上Origin就可以涵盖及大多数的科研绘图。

④不单单这些,你也可以选择模板功能,创建自己需要的图表,非常多样化。Origin的用户界面非常友好,简单但功能齐全的菜单结构、易于理解和使用的快捷键和工具栏都为我们提高了效率。而且还有一些交互式的提示和帮助,可以更加快速和顺畅的进行操作。

缺点:界面设计有时候不够直观,例如标签和图例编辑可能比较困难。但是一般系统自己的配色就可以直接使用了,如果你对配色要求较高就是缺点了。

3.MedPeerMedpeer是一款非常有特色的绘图工具,如果你是医学或生物学专业的学生,那么你一定要知道Medpeer的存在。Medpeer结合了科研所必须使用的Prism、Origin和SPSS等功能,一站式科研服务平台。Medpeer主要是面向医学和生命科学领域的研究人员和医生,提供各种常见的统计图表和数据可视化工具。它可以帮助用户绘制图表:散点图、折线图、柱形图、饼图、热力图、箱线图、生存分析曲线、风险比图、K-M曲线。由于前面Prism和Origin介绍过这几种类型的图,就不再多说了。那我就告诉你们Medpeer的特别之处:

①Medpeer结合了spsspro功能网站上可以找到的数据分析网站是spssau,spsspro但看着给名称就可以看出来是升级版,确实有些功能spsspro要比spssau多得多。做过统计学分析的同学应该就清楚,比如p值、线性回归分析、OR值等都可以用到spsspro。可以先去试一下网站版spssau,你会发现一些基础的统计学计算的可以得到解决,但有些复杂一点的就需要使用到spsspro或者SPSS原版工具。我前面提到Origin不可以处理数据,这里数据处理就可以选择Medpeer的spsspro功能了。

②数据可视化,就是Medpeer处理过的数据可以直接在Medpeer上绘出,比如散点图、折线图、柱形图、饼图、热力图、箱线图、生存分析曲线、风险比图、K-M曲线等等。比如,依据学科、模板分类、研究方向进行分类,这就更好地对数据进行系统地分类。

最强大的功能隶属它的生物绘图功能,涵盖了医学类所需要的科研图。例如、口腔科学、妇产科学、生物膜、蛋白质、细胞结构、物种(小白鼠、罗非鱼、鲫鱼、植物等实验用材)。不单单只这些,每个类别里面还有无数小分类,例如细胞结构分细胞器和细胞骨架。自己就可以组件出来需要的模型,不用花费大价钱请专业人员画。(Ps:本来我也有个画蛋白酶相关的任务,但当时还不知道Medpeer这个网站而错过了,所以尽早知道尽早学,机会总是留给有准备的人。)

这是迄今为止看到的功能最齐全的科研网站,涵盖了Prism、Origin和统计学工具SPSS。建议如果是医学、生物专业或者相关学术研究的学生把这个网站用起来,对以后的学术研究肯定是有帮助的。而且这个网站还有论文翻译、润色、辅助写作、上下文例句推荐的功能,媲美中配版Chatgpt。

缺点:这个缺点也是Prism、Origin的缺点。SPSS原版工具做出来的统计学指标和参数等都非常详细,比如是由哪个人的公式算的、P值应该参考哪组,OR值的上下限范围不应该超过多少,而Medpeer做出来的可能只是结果。但是这个结果也是准确的,只是如果你需要更具体的参数就需要使用原版的SPSS,基本上Medpeer的spsspro功能就已经足够使用了。Medpeer有3天的免费使用期,可以体验体验。

4.SPSS

前面已经提到很多次SPSS了,它还有网站版spssau和Medpeer里面的spsspro。网站的就倾向于结果,原版本SPSS就计算结果的各种参数都比较全。例如,网站算出来OR只有个结果和上下限,原版算出来也有这个,但是增加了P值来表明这个OR值有没有统计学意义。可以去试试看网站版和原版,算出来的结果都一样。

①可以对数据进行加权、做Logistic回归分析,算P值,还有用Medpeer和Origin做热图时的相关性数据也可以用SPSS算出来。我认为是数据-转换、分析这三个功能比较好用,但可视化效果差,画图的话还是选择Medpeer和Origin更好一点。

②基本上你使用SPSS都要去找教学视频,因为这个功能专业性太强了。我每看完一个视频都要保存起来,因为操作流程复杂记不住,又怕下次还用到。有老师说,SPSS的统计学也是一门专门的学科,如果学好SPSS的操作以后也是可以当饭碗

如果你已经进阶了,不再使用Prism。

技巧流程:

①首推首推:MedpeerMedpeer-Ai

SPSS/Medpeer-OriginSPSS/Medpeer-Origin-Ai

原因:Medpeer提供了spsspro就相当于简单版SPSS。如果你想要把横纵坐标变得好看,就截取图部分去Ai,自己描横纵坐标,当然PPT上也可以。当然Origin同理。



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