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如何绘制漂亮的载体示意图?

2024-06-02 15:00| 来源: 网络整理| 查看: 265

接着,通过文件菜单下的置入命令,将文献中的参考图“置入”到当前画板中。

使用矩形工具绘制长方形(完全覆盖掉右边的质粒示意图),如下图,然后使用小黑工具(选择工具)同时选中矩形和参考图,右键,建立剪切蒙版。

这样,我们就可以裁掉一部分,只保留一个“质粒”用于接下来的案例演示。适当调整参考图的位置和大小,创建新的图层。

2. 绘制参考线

手工绘制质粒最难的部分就是酶切位点(启动子、基因)准确位置的确定。我们可以使用极坐标网格工具绘制网格(主要是包含圆心)辅助绘图,使用键盘的四个方向键可快速增减“经纬线”的数量。

以文献的质粒示意图为例,序列的起始位点位于圆的最高点(全长4114bp),如果想要准确获得酶切位点(启动子、基因)的位置,我们可以将序列的长度转换成夹角的大小。例如,酶切位点 XbaI 位于297bp处,对应的夹角为297×360/4114=25.99°。因此,使用 椭圆工具绘制正圆(按住Alt键从圆心开始绘制),绘制垂直的竖线后,使用旋转工具旋转大约26度,如下图,即可得到酶切位点的准确位置。

同样的方法,可以确定其他酶切位点的准确位置,如下。

3. 绘制质粒

选中上方的正圆,Ctrl+C复制,Ctrl+F“原地”粘贴,调整圆的描边粗细和颜色。然后使用剪刀工具,根据参考线与圆的交点,在圆上添加“断点”,如下。

使用小黑工具删掉(Del键)非启动子(或基因)的片段,然后通过描边窗口为剩余的片段添加箭头(这里选箭头样式6),如下。

接着,选中所有的箭头,通过对象/路径下的轮廓化描边命令将箭头转成“填充”图形。

接着,通过路径查找器下的联集命令,将每个箭头中的两个图形融合起来。

然后,为箭头添加描边颜色,这里设为黑色,粗细为1pt,如下。

当然,我们也可以选中每个箭头,为它们指定不同的填充颜色,如下。

这样,质粒的基本框架就完成啦。接下来只需要使用钢笔工具(或直线段工具)绘制指示线,并添加文本标签即可。注意,酶切位点的字体需要斜体,酶切位点的字体我这里使用的是Times New Roman,如下。

最终的绘制效果如下:

参考文献

Zutz A, Hamborg L, Pedersen L E, et al. A dual-reporter system for investigating and optimizing protein translation and folding in E. coli[J]. Nature Communications, 2021, 12(1): 1-15.

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