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本期介绍利用UpsetR包大于5个样本的“维恩图”,即集合图
上期“【R语言】——VennDiagram包绘制维恩图(Venn diagram)保姆级教程”介绍2-5个样本绘制维恩图的方法,但当样本超过5个时,常规维恩图可视化结果的直观性及数据的捕捉就很困难,甚是不友好。因此,可采用一种特殊的“维恩图”——集合图(upset plot)。 集合图(upset plot),集合图不受样本数量的限制。可以更直观的显示各组数据之间的交互情况。可以更清晰的展示多个数据集的交集情况。 下图为集合图的说明: 1 数据准备数据输入格式(xlsx格式): 2 R包加载及数据导入 #下载包# install.packages("UpSetR") install.packages("RColorBrewer") install.packages("openxlsx") #载入包# library(UpSetR) library(openxlsx) library(RColorBrewer) #读取数据# data |
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