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背景介绍 随着高通量测序技术不断突破,如今二代测序的应用已经十分广泛。但NGS文库构建,尤其是目标区域捕获的建库过程较为复杂,一般周期为2-3天,人工操作步骤多达上百步。任何一步的操作失误都会影响到最终的结果。 为了提高目标区域捕获建库的效率与通量,降低人工操作带来的不确定性,奥美泰克与武汉凯德维斯生物技术有限公司共同开发了NGS杂交洗脱自动化流程,该自动化流程一次通量为96个样本。该自动化流程结合凯德维斯自主研发的病原体液相杂交捕获试剂盒对人上皮细胞来源DNA进行杂交捕获建库,达到对特定病原体感染进行诊断,并为临床治疗提供决策依据的目的。 自动化解决方案 一.二代测序杂交洗脱流程图 二.在LH-1209 高通量液体处理工作站,自动化完成91个样本的杂交洗脱流程 步骤一:打开软件,选择“杂交洗脱”程序 步骤二:按程序台面要求,进行台面布置,如下图 步骤三:点击”Start”运行,程序运行 三.实验结果及数据展示 备注:有效Reads=人+目标病原体+Control 部分样本的平均测序深度 从实验步骤来看,LH-1209工作站可以帮助用户进行NGS杂交洗脱全流程,一次台面布局,操作简便。从实验结果来看,91个样本的数据满足生信分析质控标准,是可靠的。 杂交洗脱的自动化流程实现,提高了二代测序文库构建的效率,促进了二代测序技术的临床应用。 |
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