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大分子量蛋白WB师兄有一点小经验要传授给你!

2023-12-28 05:15| 来源: 网络整理| 查看: 265

大分子量蛋白WB师兄有一点小经验要传授给你! 英文特生物技术北京有限公司  6月5日

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大分子量蛋白WB一直被大家吐槽难做,各种没结果,今天特意总结了师兄的一些tips给大家,快干了这杯干货!

样品制备

大分子量蛋白不好提取,因为许多大分子量蛋白是膜蛋白,膜蛋白属于非可溶性蛋白,且表达量通常较低,一般使用溶液法(RIPA等)裂解时,通常会丢失在不可溶组分中,所以要选择合适的方法来进行蛋白的提取或富集。提取总蛋白时建议适当延长孵育时间,有助于大分子量蛋白的充分裂解!(有效的提取总蛋白方法点击这里,富集膜蛋白的方法点击这里)

 

SDS-PAGE电泳   

 

1

分离胶的使用及浓度

  

凝胶主要有Tris-Glycine, Bis-Tris and Tris-Acetate三种,Tris-Glycine凝胶的PH为8.6,Bis-Tris凝胶的PH为6.4,Tris-Acetate 凝胶的PH为7。推荐使用Tris-Acetate 凝胶跑大分子蛋白,会呈现更高的分辨率。凝胶浓度与孔径成反比,即凝胶浓度越小,孔越大,较大分子量的蛋白质更容易通过,所以建议使用6-8%浓度的分离胶,当然也可以使用梯度凝胶。

 

经过小编的阅读查找,给大家找到了详细的参考资料以及Tris-Acetate 凝胶3-15%的梯度胶配方。(点击这里索要详细配方及参考文献)

2电泳

  

电泳时,可采用120-150V的高电压,在冰水浴中进行,尽量使Marker拉开足够大的距离,通常需要4小时左右。

一些经验值:师兄A:120V电压,4小时,245KD Marker条带差不多到分离胶中间位置。

转膜  1 转印膜的选择  

跑大分子量蛋白,一般建议使用0.45um的PVDF膜。

2切胶

浓缩胶不要切得太过,因为很有可能条带就在浓缩胶和分离胶交界以下2mm处(还有可能许多分子量超过250KDa的蛋白就残留在浓缩胶中)。

3Transfer buffer

Transfer buffer中的甲醇容易让大分子量蛋白沉淀,所以减少Transfer buffer中甲醇百分比(10%或更低)来避免这种情况发生,并添加SDS至终浓度为0.1%,进一步确保蛋白质不会沉淀。

4 转膜 湿转法与半干转法均可(湿转获得条带更好,半干转转膜效率高)

湿转法,以下是师兄B摸索出来转膜时间(仅供参考) 

蛋白分子量 转膜电流 转膜时间 150-180KDa 300mA 3-3.5h 180-250KDa 300mA 4-5h 大于250KDa 300mA 5.5-6h

 

半干转,以下是师兄C摸索出来转膜条件(仅供参考) 

恒压40V电压,转膜60-90min,一般小于400KDa的蛋白都能转到PVDF膜上。恒流法转,电流大小设置为PVDF膜的面积,转1小时左右即可,若怕转膜过头,可以将两张PVDF膜重叠起来(总会有一张膜上有条带)。

其他注意事项 强烈建议转膜后,使用丽春红染液染膜(Invent Cat# WA-004),检验转膜效率,蛋白条带分布和上样量如何,如果染色后无条带,则需考虑样品问题及转膜问题,进行调整。( 丽春红染色怎么做点这里)

因为多数大分子蛋白是膜蛋白,表达较少,建议适当增加上样量,并延长一抗孵育时间。

 

大分子蛋白与PVDF膜的结合不是很牢固,容易脱落,洗膜时要操作轻柔,不要过于粗暴,否则抗原抗体复合物容易脱落。

 

不知道以上的Tips是否帮到了做大分子量蛋白WB的你,在看的师兄师姐们,还有哪些做大分子量蛋白WB的经验也欢迎在留言区留交流哦!

 

 

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WB内参条带调不齐是怎么回事?

 

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磷酸化蛋白WB做不好?原因竟有可能是因为......

 

细胞凋亡WB没成功,你是不是用了RIPA?

 

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