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1,SMART入门,蛋白结构和功能分析
详细: http://www.liucheng.name/?p=738 2,Sanger的Pfam数据库网址:http://pfam.sanger.ac.uk/ 目前的版本:Pfam 23.0 (July 2008, 10340 families) The Pfam database is a large collection of protein families, each represented by multiple sequence alignments and hidden Markov models (HMMs). 3,NCBI的CDD(Conserved Domain Database)数据库 网址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi Proteins often contain several modules or domains, each with a distinct evolutionary origin and function. NCBI’s Conserved Domain Database is a collection of multiple sequence alignments for ancient domains and full-length proteins. 最后,自己试验一下。上面两个图的结果的数据是用了NP_776850的蛋白序列。你也可以拿这个序列来运行一下看看。 有点相关的文章ORF Finder使用说明及基因预测 (0.811)SMART入门,蛋白结构和功能分析 (0.811)图解:如何在NCBI上找到HNF-4基因第4个外显子的序列 (0.514)NCBI在线Blast的图文说明 (0.514)COBALT:NCBI在线蛋白多序列比对(比ClustalW还强大的工具) (0.514)【弦动我心】心中的小王子 (RANDOM - 0.358) |
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