VASP+VTST编译安装

2023-08-17 16:03| 来源: 网络整理| 查看: 265

因为要做过渡态计算，所以编译安装了VTST，下边简单介绍以下其过程，主要参考资料为VASP 5.4.1+VTST编译安装和大师兄网部分教程，之前自己也写过安装VASP的全过程，这部分是接着之前的安装做得所以很多修改介绍的不是很详细，大家如果有问题也可以翻看之前的。

1、VASP+VTST编译安装

(1) 设置VTST 将vasp及vtstcode软件下载解压后，进入vasp软件解压后文件夹，将vtstcode中的文件复制到vasp文件夹下的src中，因为src目录下存在chain.F，建议先备份chain.F（如觉没必要，也可不做）：

cd vasp.5.4.4 cp src/chain.F src/chain.F-org

将vtstcode-178目录下文件复制到src下：

cp /home/lwl/桌面/vtstcode-178/* src/

修改src/main.F源码：将（第3146行）

CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, & LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6)

变为：

CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, & TSIF,LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6) ! LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6)

修改编译配置src/.objects，在chain.o前（大概第72行）添加如下内容：

bfgs.o dynmat.o instanton.o lbfgs.o sd.o cg.o dimer.o bbm.o \ fire.o lanczos.o neb.o qm.o opt.o \

注意\后不能有空格。 (2)查看所用编辑器、IntelMPI环境和IntelMKL环境，确保可用（出现目录即可，如有问题请参考VMware 虚拟机安装VASP全过程）

which ifort echo $MKLROOT which mpiifort

(3)修改makefile.include文件用arch/makefile.include.linux_intel做模板进行修改

cp arch/makefile.include.linux_intel makefile.include

对makefile.include文件进行如下修改，14行开始编译器配置改为

FC = mpiifort FCL = mpiifort -mkl

23行开始,数学库配置改为

MKLROOT=/opt/intel/compilers_and_libraries_2018.3.222/linux/mkl MKL_PATH = $(MKLROOT)/lib/intel64 BLAS =-L$(MKL_PATH) -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread LAPACK =-L$(MKL_PATH) -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core -lpthread BLACS =-L$(MKL_PATH) -lmkl_blacs_intelmpi_lp64 SCALAPACK = $(MKL_PATH)/libmkl_scalapack_lp64.a $(BLACS)

30行，配置为(其中/opt/fftw是我编译后安装的目录)

OBJECTS = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o \ /opt/fftw/lib/libfftw3_mpi.a INCS =-I/opt/fftw/include

编译完成。我的makefile.include (4)安装为防止以前编译好的.o和.a文件与新修改的编译配置冲突，可通过以下命令清除以前编译文件：

make veryclean

编译安装：

make

安装完成在./build中生成了gamma版本的vasp,非线性版本的vasp,标准版本的vasp

gam ncl std

每个文件夹中都有一个vasp的可执行文件。 (5)添加环境变量

把VASP添加到PATH后，可以通过直接输入vasp运行例如我,新建了一个文件夹，里面创建三个软连接，分别指向三个版本的vasp，再将该目录设置为PATH目录，通过vasp_gam,vasp_ncl,vasp_std分别运行三个版本的vasp

mkdir ~/soft/vasp cd ~/soft/vasp ln -s /home/lwl/桌面/vasp.5.4.4/build/gam/vasp vasp_gam ln -s /home/lwl/桌面/vasp.5.4.4/build/ncl/vasp vasp_ncl ln -s /home/lwl/桌面/vasp.5.4.4/build/std/vasp vasp_std

在~/.bashrc中添加

export PATH=/home/lwl/soft/vasp:$PATH

编译~/.bashrc

source ~/.bashrc

或使用完整路径，如/home/lwl/Desktop/vasp5.4.4/build/gam/vasp也可以 (6)为vtstscripts脚本添加环境变量将vtstscripts.tgz解压，并将其复制到~/soft/vtst目录下。

mkdir ~/soft/vtst cp -rf /home/lwl/桌面/vtstscripts-937 ~/soft/vtst

在~/.bashrc文件添加：

export PATH=/home/lwl/soft/vtst/vtstscripts-937:$PATH

之后就可以用啦，如采用nebmake.pl in fin 7进行插点等。

注：博主也是刚开始学习，如有问题欢迎各位大神批评指正！

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