TOPOS操作流程

TOPOS

简易教程

1. 

打开

TOPOS 4.0 Professional

软件

→

Databas

→

Import

，选择

cif

文

件（随便取名）→点击

yes

→输入

1

→一直

OK

到底，界面显示为

Compounds. 

2.

点击

（

Run AutoCN

）→点

Run

→关掉当前窗口→选择

yes. 

3. 

点击

（

Run IsoCryst

）

，出现图形界面→再点击此小铅笔按钮，出现不完整

结构→接着点击

（

Growing structure

）

长出完整结构→找出与金属原子配位的

原子，

记住需要将配位键弱化为氢键的键→双击分子式→在

中选择

需要弱化的键，右击→

→

→点击

save

保存

. 

4. 

（无需弱化为氢键时不需要这一步，如单核）

关掉界面，回到主菜单→点击

（

Run ADS

）→点击

Options

→

Common

下选择

第

3

个

→

Topology

下

全

都

不

选

→

H 

bonds

处

记

得

选

择

Mol

→

OK

→

Run

→

Yes

→

1

→点击

Whole molecule

→

OK. 

5. 

回

到

主

菜

单

，

点

击

Compound

→

选

择

最

下

方

的

倒

数

第

二

行

→再选择第四行的

→

OK

→

OK. 

6. 

再回到主菜单，点击

（

Run ADS

）→点击

Options

→

Common

下选择第

2

个

→

Topology

下选择第

3

和第

5

个

→

H bonds

处记得

选择

None 

→

OK

→

Run

→

Yes

→全选→

OK

（出分析结果）

。

7. 

点击

（

Run IsoCryst

）

，画拓扑结构（最好用

Diamond

画）

。