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今天与大家浅聊一下STR,首先什么是STR呢? STR(Short Tandem Repeat,短串联重复序列)基因位点由长度为3~7个碱基对的短串连重复序列组成,这些重复序列广泛存在于人类基因组中,可作为高度多态性标记,被称为细胞的DNA指纹。 STR基因座位上的等位基因可通过PCR扩增区域内重复序列的拷贝数的不同来区分,在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别,随后通过一定的计算方法,即可根据所得的STR分型结果与专业的细胞STR数据库比对从而推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系名称。 那么STR的鉴定结果能说明什么呢? STR的鉴定结果能证明以下问题: 1. 是否为人源细胞;2. 是否为标准细胞系;3. 是否存在物种内交叉污染。 为什么要进行STR鉴定? 据统计,约18%~30%细胞系被交叉污染或错误辨识,使用该细胞可能导致研究结论错误、结果不可重复、临床细胞治疗灾难性后果等。 2009年起,NIH和ATCC呼吁研究者对细胞进行STR鉴定并着手建立细胞STR数据库。如今,细胞STR鉴定已是鉴别细胞身份及交叉污染的金标准。多数权威期刊也要求作者投稿时提供细胞STR鉴定证明。《中国药典》中明确规定,新建细胞系/株、细胞库和生产终末细胞应进行鉴别试验,以确认为本细胞,且无其他细胞的交叉污染。 |
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