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亲子鉴定str分型和snp检测的区别?

2023-01-12 18:12| 来源: 网络整理| 查看: 265

摘要: 亲子鉴定str和snp检测的区别?STR分型比SNP分型对样本要求高,相对应的样本信息含量也高,STR遗传标记是重复序列为2-5个核苷酸,含有多个等位基因,SNP遗传标记多数为二等位基因,碱基替换或颠换,这就是为什么SNP更稳定,对样本要求

亲子鉴定str和snp检测的区别?STR分型比SNP分型对样本要求高,相对应的样本信息含量也高,STR遗传标记是重复序列为2-5个核苷酸,含有多个等位基因,SNP遗传标记多数为二等位基因,碱基替换或颠换,这就是为什么SNP更稳定,对样本要求低且检测成本低的原因;STR遗传标记可复合扩增15-20个位点,SNP遗传标记复合扩增50个以上的位点,这也是为什么SNP能够对表亲这样的亲属关系进行鉴定。

STR分型亲子鉴定

STR(Short Tandem Repeat),即短串联重复序列。STR 是人类基因组中广泛存在的一种重复结构核心序列(由 2~6 个碱基组成),核心序列串联重复排列,重复次数的不同构成长度多态性。通过对这种多态性的检测,就可以明确区分个体与个体的不同,确定亲缘关系。一般采用 16~50 个位点来参与计算,位点越多,计算越精准,同样成本也越高。

优点:因其具有成本低,操作简单的特点,被众多机构及一些公益组织所采用。

缺点:亲子鉴定中常会发生 STR 突变的情况(0.1%),突变对亲子关系的判定会造成困扰,所以在二体连测时会出现「不排除亲子关系」的结论。由于采集位点限制,无法有效支撑对全同胞关系之外的鉴定。

SNP亲子鉴定

SNP(Single Nucleotide Polymorphisms),即单核苷酸多态性,又被称为第三代遗传标记,是指在基因组上单个核苷酸的变异,包括转换、颠换、缺失和插入,形成的遗传标记,其数量很多,多态性丰富。结合新一代测序技术,可以通过计算大量 SNP 基因位点(检测位点 ≥5000 个)来精准判定亲属关系。

优点:突变率低,鉴定结果精准度高,对于很远的亲缘关系也可提供可信的判断。

缺点:技术难度高,测序复杂,现阶段鉴定成本还大大高于 STR。

STR分型与SNP亲子鉴定对比结果如下:

1. SNP 具有高多态性,低突变率的特点,比 STR 更为稳定,当 STR 鉴定无法下结论时,SNP 鉴定可以做出准确回答。

2. SNP 检测位点量要远多于 STR,市面上常见的 STR 检测多为 16~50 个位点不等,而 SNP 的检测位点则为 ≥5000 个,23魔方寻亲检测使用的 SNP 检测量是 80万+。因此可以得到的信息量也远超 STR 检测。

3. 十几个或数十个位点的 STR 鉴定能对亲子关系(全同胞)提供充分的依据信息,但当鉴定范围扩充表亲、堂亲乃至到更远的亲缘关系时,则只能依靠大量的 SNP 位点鉴定提供信息。

4. SNP 检测对样本质量要求比 STR 较低。DNA会在极端条件下降解,造成 STR 数据提取困难,如美国 9.11 事件中很多遇难人员因为高温焚烧过导致无法用 STR 来确认身份,就是通过 SNP 实现的。

怎么判断鉴定方式用的是STR还是SNP呢?

答:一看鉴定机构提供的说明;二看鉴定位点数量,十几个或者数十个位点的就是 STR,几千上万位点的就是 SNP。



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