全基因组Survey

2024-07-18 04:24| 来源: 网络整理| 查看: 265

2.Survey是评估基因组的有效手段，对于没有参考基因组的物种，在启动de novo 项目之前，对基因组特征评估是十分必要的，基因组大小及复杂状况直接影响到项目价格，周期以及后续的组装策略等。 Survey评估和流式细胞仪评估有什么区别？

两者都可以对基因组的大小进行评估，Survey评估中的K-mer分析是从数学角度上进行分析的，得到的信息更为全面和准确。而流式则是通过实验的手段，主要通过已知内参物种基因组大小来评估被测物种的基因组大小。由于内参选择不同，实验预估基因组大小与实际会有一些偏差。