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Supersmart pUC57平黏端通用TOPO克隆载体 (ZS

2024-07-13 16:50| 来源: 网络整理| 查看: 265

简介:

 

pUC57 Simple 通用克隆载体采用了 TOPO 酶连接技术,载体预先偶联上 TOPO酶,当加入 PCR 扩增产物后,5 min 就可以完成连接反应,连接阳性率高。pUC57 Simple 通用克隆载体消除了大部分的常用酶切位点,便于后续亚克隆。该产品适用于 Taq 酶扩增的含“A”尾巴和高保真酶扩增的 PCR 产物的连接,载体含有氨苄青霉素抗性筛选标记。

 

产品特点:

 

(1)快速连接,最快仅需 5min;

(2)操作简单,仅需加入载体和片段即可;

(3)无需蓝白斑筛选,阳性率高;

(4)不包含任何酶切位点,便于后续亚克隆;

(5)平末端和 A 尾产物通用。

注意:引物不能磷酸化。

 

测序引物:

 

正向测序引物:M13F(-47): 5’- CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGAC-3’;

反向测序引物:M13R(-48): 5’- AGCGGATAACAATTTCACACAGGA-3’;

pUC57 Simple TA/平端通用克隆载体图谱

图片1.png 

 

操作方法: 

 

1. PCR 产物的纯化

1.1 PCR 扩增完毕后,电泳检测产物,如无非特异性扩增、无引物二聚体、条带单一明亮,则可采用 PCR 产物纯化试剂盒纯化后用于连接。产物不经纯化也可以进行连接,但效果稍差一些。

1.2 PCR 扩增完毕后,电泳检测产物,如有非特异性扩增条带或引物二聚体,则必须采用胶回收后用于连接。

1.3 PCR 扩增模板来源于 Amp抗性质粒,则必须采用胶回收后用于连接。

2. PCR 用量和连接时间

PCR 产物大小

 PCR 产物用量

载体用量

摩尔比

连接时间

阳性率

0.1~1kb

2~10ng

1 μl

1: 5~10

5~10min

>95%

1~3kb

10~20ng

1 μl

1: 5~10

15~20min

>90%

>3kb

5ng/kb

1 μl

1: 5~10

30min

>85%

3. 连接反应

向0.2 ml EP 管中依次加入如下试剂

成 分

用 量

PCR 产物

0.5~4 μl (用量参考上表)

pUC57 Simple Vector

1 μl

加无菌水至总体积为

5 μl

轻轻吹打混合均匀后,室温(25°C)孵育 5~30min,通常放置 10min。

关于 PCR 产物的用量说明:

在 PCR 产物回收后(在无法进行 NanoDrop 测定浓度的情况下),按照一般的经验可估算产物的用量,原则为:3 μl 回收产物在琼脂糖凝胶电泳后,可清晰判断的情况下,使用 0.5~1 μl 回收产物(约 5~15 ng)进行连 接即可。回收产物难以观察的情况下使用 4 μl 回收产物(约 5~10 ng)进行连接。使用过高量的 PCR 产物将会导致连接效 率低下,长斑数量和阳性率急剧下降。

4. 转化

4.1 取5-10 μl上一步骤的反应样品加入到50-100μl DH5α等感受态细胞中(注意所加入的DNA样品体积不要超过感受态体积的1/10),轻轻混匀,将该混合物置于冰上30 min。4.2 42℃水浴中90秒进行热激,然后迅速放回冰浴中,静置3~5 min。

4.3 加入500 μl不含抗生素的SOC或LB培养液,轻轻混匀,37℃震荡培养1h。

4.4 将菌液5000 rpm离心1 min以沉淀菌体。吸去大部分培养液,剩余约50-100μl的培养液,重悬菌体。然后全部均匀涂布到含适当抗生素的LB平板上,37℃培养箱中培养过夜。4.5 第二天挑取平板上的克隆进行菌落PCR或者提取质粒进行酶切鉴定,也可以挑取至少 3 个克隆进行测序验证。

5. PCR 菌检挑选阳性克隆菌落(连接产物条带单一、清晰情况下,阳性率>95%,可无需菌检,直接测序,本步骤可省略)

5.1 用 10 μl Tip 头挑取生长良好的单个菌斑,放置于 10 μl 无菌水中吹打几次混合均匀。

5.2 取 1 μl 上述菌液于 20 μl PCR 体系中,用 PCR 特异性引物或者 M13F(-47)和 M13R(-48)鉴定阳性克隆。

PCR 反应体系

PCR 反应条件

 反应体系

用量

温度

时间

5XEffcient Taq PCR Master Mix (with Dye)

4 μl

变性

95°C

30 s

M13F(-47) (10 μM)

1 μl

循环 25~30

95°C

10 s

M13R(-48) (10 μM)

1 μl

58°C

20 s

菌液模板

1 μl

72°C

2kb/min

灭菌双蒸水

13 μl

72°C

2 min

5.3 以上述菌液为模板进行 PCR 扩增,并电泳检测(如载体自连接,则菌检 PCR 扩增长度为:140bp)。

6. 质粒提取及测序

将鉴定为阳性的菌液接种于 5ml LB 培养基中(含 100ug/ml 氨苄青霉素),37°C 振荡(225 rpm)培养过夜,提取质粒。并使用 M13F(-47)或 M13R(-48)进行测序。

 

常问题及分析: 

 

1. 问题:平板克隆数少或不长斑

原因:通常是由于感受态效价较低造成,更换感受态可解决问题。平板为 100μg/ml 氨苄青霉素抗生素,检查是否用错。

2. 问题:阳性率低

原因:连接 PCR 产物有引物二聚体、连接产物条带不明亮(浓度不够)。

3. 问题:鉴定条带大小与预期不符

原因:PCR 产物在回收过程中发生断裂,造成小片段产物,在连接大片段时尤其严重。菌检产物大小为 140bp+目标产物 大小,如插入片段为 500bp,则菌检阳性克隆为 640bp。

4. 问题:提取的质粒是否能进行酶切鉴定

回答:该载体上不携带任何常规酶切位点,除非产物自带酶切位点,否则不能酶切鉴定。

 

储存:

 

-20℃可保存 2 年,-80℃可保存 5 年,避免反复冻融。

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