【干货】FlowJo 10.7.2数据处理基本操作

对于大多数流式细胞仪的用户来说，FlowJo这个软件是既熟悉又陌生。众所周知，FlowJo是处理FCS格式数据最好的帮手，但是要怎样运用该软件得到漂亮的数据呢？接下来我就以血液样本为例，为大家简单介绍最新版的FlowJo 10.7.2基础操作。

1.数据导入

打开软件以后点击“Add Samples...”选择你需要处理的数据导入其中即可，当然也可以简单粗暴的直接把单个数据或者文件夹直接拖拽到软件里，这两种途径的目的与结果都是相同的，随意选择。

2.横纵坐标调节双击第一数据，得到FSC-SSC图，点击“T”选择“Customize Axis...”修改“Scale”里“Linear”的数字大小即可改变图形坐标，纵坐标同理可得。

3.画门分析数据在FSC-SSC的窗口里选择适合你的任意一种形状的门，我这里是选择用椭圆形圈出淋巴细胞群。接着点击下一级“绿色三角”按钮，进入下一步窗口的调节。进入下一级后，首先要做的是点击横众坐标的“黑色三角”按钮，选择对应参数（我这里选择了CD3+）。其次点击“T”修改“Scale”里“Biex”的数字大小即可改变图形横众坐标坐标，得到漂亮的图形。以此类推，可以一直分级画下去，同一级里也可以画多个独立的门。

此时，你可能会说如果我只是单色怎么办？单色不但可以画门，还可以做出漂亮的叠图

图4

如图4将FSC-SSC窗口的下一级的横坐标依然调成“CD3+”，但是横坐标选择“Histogram”，接着上面那栏选择单/双门。选中图片后点击鼠标右键，选择“Copy to Layout Editor”即可将图片导入“Layout Editor”或者直接拖拽过去也行。

图5

当所有图片都到“Layout Editor”里时，来回拖拽每一张图片使它们自动重叠（如图5）；

图6

选中图片后单击鼠标右键找到“Histogram”，里面有四种不同排列的方式（如图6），选择你最喜欢的一种即可。

4.单个数据的门应用到全部数据如图选中第一个数据所有窗口，用鼠标将其拖拽到上方的“All Samples”就可将其应用到所有数据，然后根据实际情况调整每个样品的门。

5.保存数据当数据处理好了之后，最重要的是保存，不然你就能感受到什么叫揪心的痛，哈哈哈！保存有多种方式，其中最主要的是先保存“Workspase”。只有保存了“Workspase”，你的工作才算没有白做，后期想怎么再修改都可以。如图在“File”窗口点击“Save As...”里的“Save As Workspase (WSP)”，即可保存Workspase。与Workspase同样重要的是“Save As...”里的“Export as Template”，这是保存数据模板的路径，它可以让我们的工作事半功倍。下次处理同样的数据直接“Open”模板导入需要处理的数据即可，不用再浪费时间其重复同样的工作了。