R包的查看、卸除、安装与卸载

2023-07-31 21:52| 来源: 网络整理| 查看: 265

01. 卸载自己古老的包

查看自己的包

mypackages % as.data.frame() write.csv(mypackages, "~/Desktop/mypackages.csv")

从存的文档中找到自己想要卸载的R包

remove.packages(c("BSgenome.Athaliana.TAIR.TAIR9", "BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19", "GenomeInfoDb", "GenomeInfoDbData", "GenomicAlignments", "GenomicFeatures", "GenomicRanges", "GO.db", "GSEABase", "KEGGgraph", "KEGGREST", "learnr", "RgoogleMaps", "RSQLite", "yeastRNASeq", "yyplot"), lib = .libPaths()[1]) remove.packages(c("IRdisplay", "IRkernel"), lib = .libPaths()[2]) mypackages % as.data.frame() write.csv(mypackages, "~/Desktop/mypackages_new.csv")

查看之后上述的包已经被卸载了。

02. 补充部分

查看已加载的包

(.packages())

卸除已加载的包

detach("package:RMySQL")

注意是卸除，不是卸载，也就是说不是把包从R运行环境中彻底删除，只是不希望该包被加载使用。

在包使用函数冲突，检验函数依赖时比较有用。

安装包

install.packages("TSA")

列出包所在库的路径

.libPaths()

包的载入

library() 或 require()

安装完包后，需要加载才能使用其中的函数，此时括号中不使用引号。两者的不同之处在于library()载入之后不返回任何信息，而require()载入后则会返回TRUE，因此require()适合用于程序的书写。

包的更新

update.packages()

彻底删除已安装的包：

remove. packages(c("pkg1","pkg2") , lib = file.path("path", "to", "library"))

查看已安装的包

installed.packages()[,c('Package','Version','LibPath')]

其中c(‘Package’,’Version’,’LibPath’) 表示显示包名、版本、库路径信息，若无[,c(‘Package’,’Version’,’LibPath’)]参数，则显示所有信息。

查看某个包提供的函数

help(package='TSA')

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