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Dump还是不Dump?这是个问题

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所谓Dump设门,是指从利用多个系列特异性标记,或结合死活染料,在一个通道中,排除这些标记阳性的信号,从而排除掉不希望看到的细胞。

举个例子,下图是为了精确圈出浆样树突状细胞,为此,首先圈出BDCA-2阳性的细胞,然后再用dump channel(包含了CD3 PE、CD16 PE、CD19 PE、CD56 PE、CD14 PE、CD11c PE一共六个系列特异性抗体,你也可以叫LIN抗体,分别排除T/NKT、NK/粒、B、NK、单核、粒/单核等),圈出所有前述抗体阴性但是HLA-DR阳性的细胞,就是浆样树突状细胞了:

在过去,这种方法有助于克服可用荧光通道数量的限制,将一个荧光通道利用到了极致。 但随着现在荧光通道的增多,多色流式的普及,这种策略在一定程度上已经过时,更重要的是,Dump设门也存在一些致命缺陷。来看一下下面几个例子,理解Dump设门致命缺陷所在。

人CD20

在人类样本中,CD20是很有代表性的B系特异性抗体。但是,最近的研究发现了一个特殊亚群,约占CD3+T细胞的3~5%,该亚群共表达CD20、CD8、CD45RO,而CCR7-(参见《Features of Human CD3+CD20+ T Cells.》[1],这类CD3+CD20+的T细胞在淋巴器官和脑脊液中也存在,可被CD20靶向抗体清除。如将CD20纳入Dump设门,则会使这类T细胞被排除掉。

人CD56

CD56是NK和NKT细胞的标记,但实际上,CD56还可表达在髓样DC、浆样DC、部分外周血单核细胞、γδT等细胞上。在某些血液肿瘤和癌症上,也可表达,例如慢性粒细胞白血病CD34+CD38-干细胞通常可表达CD56。

小鼠B220

小鼠B220是CD45的一种异构形式,通常被认为是泛B细胞标记,所以常用于排除或定义B细胞。但是,B220还可表达于骨髓、脾脏中CD19-CD11c+的浆样DC,甚至在一些即将凋亡的活化T细胞上也可表达。

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小鼠CD11b

CD11b的典型的髓系细胞标记,但也可表达在淋巴细胞(如B-1、B-2、NK、NKT等)上。

小鼠NK1.1

NK1.1是NK细胞标记,但并非所有NK均表达NK1.1,例如子宫NK细胞表型通常为NK1.1-CD49b-CD3-CD122+。

上面说明了Dump的什么问题?

上述数据说明了常用的系列特异性标记,并没有那么特异,这样的话,可能导致两种主要错误:

•探索新的细胞亚群时,可能会因为被误排除,导致无法发现新亚群。•可能由于某些标记的不均一表达,导致在排除的时候排除不干净,例如CD14排除单核细胞,由于存在一些CD14 dim的单核细胞,设门时可能排除不掉。 此外,用Dump设门时,由于这个通道加入了多个抗体,所以如果漏加了其中一个,也不容易发现。 Dump设门的阈值,也会存在较大的主观性。

能不能继续用Dump设门?

•若能充分了解目标细胞群体在健康和病理状态下的表型,而非探索性寻找新亚型,并且已明确了解前述问题所在,可以采用合适的标记组合进行Dump设门。这样可以避免颜色搭配过多造成的荧光补偿调节困难,减少背景信号。•如果仪器有充足的通道可用,希望能够发现新亚群或将细胞群体分得更细,无法找到足够理想的Dump标记,那么建议放弃Dump设门,而是将Dump标记组合拆分到各个荧光通道,提高解析能力。

编译自《Flow Cytometry: To Dump or Not To Dump》[2]

References

[1] 《Features of Human CD3+CD20+ T Cells.》: http://www.jimmunol.org/content/197/4/1111.long

[2] 《Flow Cytometry: To Dump or Not To Dump》: http://www.jimmunol.org/content/201/7/1813.long

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