造物云头条

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造物云头条

2024-05-10 16:59| 来源: 网络整理| 查看: 265

大家好，我是独孤嘌呤。今天，我们来盘点一下Diamond软件中使用频率较高的工具和操作，及其对应的快捷键。这里使用的Diamond版本为version 4的演示版。

一、基本操作

选择工具（Normal selection mode），快捷键Ctrl+L

功能：单击选择原子或化学键等，按住鼠标拖动可框选

抓取工具（Grab mode），快捷键Ctrl+G

功能：按住鼠标拖动可旋转视图，按快捷键可在选择和抓取之间来回切换

旋转工具（Rotate along x/y-axis）

功能：按住鼠标拖动可旋转视图

旋转工具（Rotate along z-axis）

功能：按住鼠标拖动可旋转视图（旋转轴限制垂直于屏幕平面）

移动工具（Shift）

功能：按住鼠标拖动可移动视图

缩放工具（Enlargement factor）

功能：按住鼠标拖动可缩放视图

* 以上操作可在Move菜单及工具栏中找到。Diamond软件中的原子位置都是固定的，仅可对视图空间进行移动、旋转和缩放操作。二、视图显示

透视（Perspective）

功能：从parallel projection切换到central projection，即由平行视图转为透视视图

中心视图（Central Projection），快捷键Ctrl+Shift+P

功能：在parallel projection和central projection两种模式间来回切换

渲染模式（Rendering）

功能：模型以三维渲染的形式显示

光照（Lighting）

功能：开启默认光照

景深（Depth Cueing）

功能：开启景深效果

* 以上操作可在Picture菜单中的Picture Settings选项中找到，点击工具栏的Picture Settings图标亦可。

三、视角方向

主要通过Picture菜单中的Viewing Direction改变，可沿a/b/c晶轴的方向观察，也可以选择特定的晶面观察（设置h、k、l晶面指数）。当晶胞的三个角度α、β、γ均为90°时，a/b/c等价于x/y/z。

四、晶胞创建和删除

填充单元晶胞（Fill Unit Cell），快捷键Shift+Ctrl+U

功能：创建a、b、c三个方向均为一个单元长度的晶胞结构

Build菜单Fill选项，可选择Super Cell自动创建，或选择Range自行设置。还可以选择Box或Sphere等类型。

清除所有（Destroy All），快捷键Ctrl+Shift+D

功能：清除视图中的全部元素

清除分子（Destroy Molecule），快捷键Delete

功能：清除选中的部分

Destroy All Cell Edges

功能：清除所有晶胞边框

清除多面体（Destroy Polyhedra）

功能：清除选中的多面体

Destroy All Polyhedra

功能：清除所有的多面体

清除未成键原子（Destroy Non-bonded Atoms）

功能：清除没有化学键连接的原子

Destroy All Atoms

功能：清除所有原子

Destroy All Bonds

功能：清除所有化学键

* 创建和清除功能可分别在Build菜单的Fill和Destroy选项中找到。

五、配位和连接

连接设置（Connectivity）功能：设置原子间的连接距离阈值

连接（Connect）

功能：连接距离在阈值范围内的原子

配位生长（Fill Coordination Spheres Directly），快捷键Shift+Ctrl+S

功能：在原有结构基础上外延生长

获取分子结构（Get Molecules Directly），快捷键Shift+Ctrl+M功能：得到原子和化学键连接的模型，不一定按照晶胞堆积获取

直接生长（Grow Directly）

功能：基于原子连接的阈值设置外延生长

结构削减（Cut Back Directly）功能：基于原子连接的阈值设置直接削减Insert Bonds

功能：在任意两原子之间添加化学键

插入原子（Insert Atom）

功能：插入Dummy原子

Coordination Spheres，可自行设置外延生长的原子及用于判断的距离阈值。

Add Coordination Polyhedra，创建多面体

* 以上部分选项可在Structure和Build菜单中找到。

六、原子和化学键设置

键线式（Wires or Sticks），快捷键Ctrl+Alt+1

功能：原子半径和化学键粗细始终一致，仅可对化学键参数进行设置

标准球棍模型（Standard (Ball and Stick)），快捷键Ctrl+Alt+2

功能：原子和化学键的参数可分别控制

Picture菜单中的Atom Designs、Bond and Contact Designs、Cell Edges Design和Polyhedron Designs，可对原子、化学键、晶胞边框、多面体等参数进行更细节的设置。

七、其他快捷键

Ctrl+A，全选Ctrl+I，反选Ctrl+M，选择连接Ctrl+Z，撤销Ctrl+Y，恢复Ctrl+X，剪切Ctrl+C，复制Ctrl+V，粘贴Ctrl+O，打开文件Ctrl+S，保存文件Shift+Ctrl+E，添加晶胞边框F9，结构居中并自适应窗口F11，全屏显示切换以上为个人学习过程中总结的一些常用功能和快捷键，供大家参考。祝各位学习愉快！

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