李伟忠实验室

    21世纪是生命科学的世纪，现代医学正迅速走向精准化和智能化时代。大数据分析、生物信息、基因组测序、人工智能等技术结合发展为智能精准医学提供坚实的数据基础和高效的技术手段。生物、医学、临床大数据的整合、注释、分析、挖掘和应用是精准医学研究链条中不可或缺的重要环节。随着PB量级基因组学数据的产生和积累，以生命组学为基础的医学研究同时具有数据密集型和计算密集型特性，必须依托大规模计算和存储平台来实现。我们的研究兴趣正是基于生物医学大数据，用生物信息、大数据和人工智能等手段，开发新型算法，整合、注释、挖掘大数据，构建大数据库群，建立智能软件系统和应用大平台，支撑精准医学的研究和精准医疗的发展。

    李伟忠课题组面向精准医学的需要，利用分布式网络大平台、大型数据库群、大数据深度学习等技术手段，主要研究生物大数据分析大平台、生物信息工具与软件流开发、数据知识库构建、生物医学大数据的快速精确检索与深度智能挖掘等。曾设计和实施欧洲生物信息研究所以大数据高性能计算为基础的核心生物信息分析大平台；建立了全球最完整的生物专利序列数据库；创新性设计开发的蛋白精确迭代检索引擎 PSI-Search，新版软件的精确度超过著名同类软件NCBI PSI-BLAST的近20倍。深度参与国际重大生物信息项目，如国际蛋白数据库 UniProt、国际核酸数据库 ENA/GenBank、基因组数据库 Ensembl Genomes、多序列比对工具 Clustal Omega、大分子功能注释工具InterProScan 等，为世界范围的生物医学大数据建设和共享作出了积极贡献。

Citation details: Yang,M., Zhang,W., Yao,G. et al. Combined alignments of sequences and domains characterize unknown proteins with remotely related protein search PSISearch2D. Database (2019) Vol. 2019: article ID baz092;