新药专利中Markush结构可视化检索技巧知多少？

Editor in Chief: Jane List

扫码了解期刊

Markush结构在化学信息学，特别是化学专利中起着重要的作用。 Markush结构以Eugene A. Markush的名字命名，Eugene A. Markush于1924年被美国专利局（现为美国专利商标局，美国专利商标局）授予吡唑啉酮染料专利。他在该专利中声称具有通用的化学结构，这开创了先例，该技术成为一种普遍的做法。

Markush结构是用于指定相关化合物集合的通用化学描述。它们被 广泛应用于化学专利和其他化学教科书，以及用于描述大型组合库。

在单次的信息披露中，典型的Markush专利结构代表了大量甚至无限数量的物质。结构的不变部分称为支架，体现了特定分子的共同结构特征。为了描述差异， 在专利权利要求中通常使用以下种类的变型：

这些变化甚至可以嵌套，也就是说，替代子结构也可以包含其他任何种类的嵌套变化。嵌套的R-基团尤其常见，它们在化学专利中得到了广泛的应用，加上同源性变异，说明了 Markush结构的复杂性。在某些应用程序中还可以使用其他类型的变异，例如原子和键的变异：Markush结构中的特定原子或键可以是多种类型。但是，也可以使用R-group轻松描述这些变化。

待合成的组合库通常仅包含少量化合物（几千种或更少），但是多样性分析通常在较大的虚拟库中进行（例如，以大约或更多的顺序）。这些库通常由不涉及同源基团的组合Markush结构表示，因此可以枚举每个表示的分子（前提是需要所需的时间和空间）。相反，由于同源基团的普遍使用，Markush专利结构倾向于描述更大或无限的化学空间。

专利信息在制药业和生物技术中至关重要，这不仅是因为保护了知识产权，还因为新型化学的主要部分仅在专利中公开。Markush结构可有效地用于化学专利，因为它们为发明人提供了广泛的法律覆盖范围。这种广泛的覆盖范围尤其重要，因为相似的化合物通常显示出相似的生物学活性，因此发明人还希望通过较小的修饰来保护衍生自原始活性化合物的化合物。另一方面，在起草和分析专利权利要求，计算机表示和搜索方面，Markush结构也引入了一些困难。主要是因为专利权利要求中使用的化学语言和符号不规范，有时含糊不清或过于含糊。此外， Markush专利结构的尺寸和复杂性在过去几十年中已经增加了。

在专利起草过程中，重要的一步是根据一系列特定化合物生成Markush结构。专利申请人和律师的目标是涵盖研究小组提供的所有化合物以及其他结构相似的化合物，同时保留专利局要求的适当程度的特异性。尽管这很 困难，耗时且容易出错，但该关键步骤通常是手动执行的。

在过去的几十年中, Markush结构的数字表示和分析一直是深入研究的主题中描述了用于表示，可视化和搜索Markush结构的各种工具。

本文被ScienceDirect收入的World Patent Information在2019年发表，引起了广大研究者对以计算机算法辅助检索工具的研究热情。Reaxys的Markush检索功能也一度成为热点问题。

今天我们就为大家分享几个检索案例，让大家方便了解Markush结构检索技巧！

——Markush 结构搜索教程

应用场景：一个化学结构已经被确定在目标上具有良好的活性。 研究人员需要了解这个结构周围的专利情况，看看他们在哪里可以自由操作。

01

建立查询并检索所有匹配的物质

A 在“快速搜索”或“查询生成器”中打开“结构编辑器”。画出化学机构，包括任何变异R-基团的结构

B 确保相关标记结构和互变异构体已被选中

C单击“传输到查询”

D 此示例使用快速搜索。单击“查找”

E 从预览中选择“查看物质结果”

02

过滤信息集并检查匹配的物质

A选择“过滤器文档类型”>“专利”，然后单击“限制到”

B 从专利中把信息集减少到物质源

C 物质47是一个Markush结构

D单击文档图标以打开该物质的对话框。单击“view details”打开物质档案

03

审查专利申请的结构

A 单击文档链接以查看专利详细信息

B单击Markush details查看专利中声明的结构。请注意，如果专利中没有举例说明确切的结构，则表中的实体是不可搜索的

C 对Markush细节下的一些信息进行了更详细的查看

04

查阅专利详情

A 可以查看专利的详细信息，包括摘要、权利要求、首页信息、物质、反应和命中物质。还有全文链接

B单击“物质”以查看专利中声明的结构

结论

Markush结构检索虽然复杂，但在创新型制药企业专利情报获取中起着至关重要的作用。现代的研究人员可以通过多种计算机辅助工具，例如：Reaxys，直观的将复杂的Markush结构绘制到数据库中执行检索。同时系统可以利用Reaxys专利全文对Markush结构进行整理，加速专利研究人员对专利核心内容的理解。

告诉我们您的研发挑战，

获取爱思唯尔研发解决方案 免费试用机会！