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利用clusterProfiler实现蛋白名称、基因名称等ID快速转换 2020/4/15 3 评论 clusterProfiler 是一个非常好用的R包,可以用来做各种富集分析,如GO、KEGG、DO(Disease Ontology analysis)、Reactome pathway analysis以及GSEA富集分析等。而除了富集分析,它还可以非常方便的做蛋白、基因等ID之间的转换。 # 安装R包 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("clusterProfiler") BiocManager::install("org.Hs.eg.db")以人的蛋白、基因名之间的转换为例: # 加载R包 library(clusterProfiler) library(org.Hs.eg.db)查看org.Hs.eg.db数据库中支持多少类ID的转换: 以Uniport ID转换为例 gene |
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