BiocManager无法安装R包

2023-10-30 05:31| 来源: 网络整理| 查看: 265

每次开展R语言线下学习班，都需要重新发几次：Windows电脑使用Rstudio会有多少错误呢，虽然大部分同学都是可以根据我们的教程顺利解决问题，但是不幸的人各有各的不幸。一般来说就是Windows电脑的中文用户名需要修改电脑系统的环境变量，R包下载等等。但是今天有一个学员起初是下载R包无法联网，所以失败，根据我们的经验当然是options(download.file.method = ‘libcurl’)就轻轻松松解决啦，不过这次居然是仅仅是解决了R自带R包下载问题，使用BiocManager仍然是无法安装R包，如下所示：当然就得根据关键词去搜索啦!

> BiocManager::install("KEGG.db",ask = F,update = F) 错误: Bioconductor version cannot be validated; no internet connection? 此外: Warning messages: 第一次搜索以为是http和https的问题

参考：https://stackoverflow.com/questions/33355444/r-when-trying-to-install-package-internetopenurl-failed 大概意思是让我修改镜像把所有的https都替换为http，步骤如下：

using regular http mirrors instead of https update your CA certificate bundle to allow proper certificate validation setting the default download method to “libcurl” and see if that helps: options(download.file.method=”libcurl”) 但是尝试了，失败！第二次尝试以为是BiocManager的config文件

所以根据搜索结果使用：

config

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