听说你想把pheatmap和ggplot2拼在一起 |
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在《一个更好用的pheatmap》一文中介绍了pheatmap的新功能,它输出为一个pheatmap的对象,这个对象在终端上打出来,会出来图,你可以用ggplot2::ggsave()来保存图片,文章的结尾处卖了一个关子,就是用cowplot来拼,这个有许多人问过我,因为大家一般都认为cowplot只能用于ggplot2的输出,pheatmap感觉好像不太行,而且在很多人的感觉中,画图代码不是ggplot2写的,就是base写的,而pheatmap看上去就像是base一般,其实它是grid写的,我在下面两篇文章中都有示例代码,用于拼pheatmap,不过一般人看过了,也只是留下一点印象,终究还是记不住,因为涉及到grid的知识。 听说你还不会画热图 不同数据集画出的热图,用同样的颜色区间上色?现在我们有一种你一定能记得住的方法了,以后再也不用问pheatmap怎么拼图了,首先pheatmap产生的是一个对象,然后这个对象我们可以用ggplot2给画出来,然后自然而然你能够用cowplot去拼,再熟悉不过了,如果这都不能理解记住,那我也没办法了。 有个pheatmap的输出 d |
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