酵母杂交实验常见问题

您所在的位置:网站首页 酵母基因组提取注意事项 酵母杂交实验常见问题

酵母杂交实验常见问题

2024-07-15 19:08:21| 来源: 网络整理| 查看: 265

问9:如何判断是否转化成功?

答:平板出现乳白色单菌落,直径可达1 mm以上,判断为转化成功;如果平板出现一层菌落,或者菌落都太小,不能挑取单菌落,判断为转化失败。常见的失败多为筛选平板上没能长出任何菌落。

问10:酵母转化质粒加入多少合适?

答:对于高纯度质粒,单转建议质粒加入量100 ng以上,共转建议质粒加入量每种300 ng以上,文库转化建议文库质粒加入量为5-25 μg。质粒的加入量和转化子的数量呈正相关,为了得到较高的转化效率,对于通过NanoDrop定量的质粒,单转和共转均建议每种质粒加入1 μg以上。如出现转化失败的问题,请优先检测质粒的质量,电泳是最为简单有效的方法。

问11:转化失败的原因有哪些?

答:最常见的转化失败为空板,没有菌落长出来。大概率问题出在质粒上,首先需要对质粒进行电泳检测,电泳结果需为大小正确且明亮的条带;其次核对筛选培养基的选用和配制是否正确;排除上述因素,就需要复查酵母菌的外观气味是否正常,或者进行镜检。

问12:文库转化怎么计算转化效率?

答:文库转化需要尽可能保证文库的完整性,得到尽可能多的转化子。一般认为在缺陷平板(不含报告基因检测缺陷及抗生素平板)上得到十万个以上转化子为合格。比如10 μL的重悬产物,取1 μL稀释到100 μL涂板后得到10个以上克隆,转化实验即为成功的。

问13:酵母化学转化的转化效率一般是多少?

答:Coolaber的酵母转化试剂盒,一般转化效率(环状质粒)可以达到 10 3-5 /μg质粒。可以通过提高酵母菌的活性,或者YPD Plus复苏培养进一步提高转化效率。

问14:酵母转化的质粒是否需要线性化?

答:酵母表达实验,大多数质粒都需要线性化;酵母杂交实验,常见的线性化质粒有单杂实验中的pHisi(不是pHis2)和pAbAi,其余的质粒多是不需要线性化的。

问15:线性化质粒转化失败怎么解决?

答:由于要重组基因组,需要线性化质粒,但其转化效率远远低于环状质粒,一般每μg质粒只能得到50个以内的转化子。由于酶切体系以及纯化方法的影响,造成质粒回收效率低、质量差,是转化失败的主要因素。建议选用质粒大提试剂盒增加质粒的提取量,扩大酶切体系,改善回收方法来解决。酶切完成后,只取少量电泳检测,对于完全酶切的样品,直接用吸附柱纯化;和酶切产物全部电泳后胶回收相比,质粒的损耗率小一些。

Coolaber酵母转化试剂盒的分类及组成:

详询www.coolaber.com

酵母转化试剂盒种类及特点:

详询www.coolaber.com

酵母杂交实验常用的酵母感受态细胞:

详询www.coolaber.com

二、转化试剂盒组成及功能的问答

问1:经典转化试剂盒和Super转化试剂盒是否需要准备其它试剂?

答:需要准备DMSO,无菌水或者无菌生理盐水,无需其它试剂。

问2:Super转化试剂盒中组分的作用以及注意事项?

答:包含Y1,Y2以及Y3溶液。Y1用于酵母感受态制备,Y2用于感受态保存,Y3用于质粒转化;Y3含有单链担体DNA(Carrier DNA),产品包装为4×25 mL,为了保证产品的稳定性,长期不用请置于-20℃保存。

问3:50% PEG3350溶液是否可以高压灭菌?

答:经过Coolaber检测,PEG3350高压灭菌可以用于酵母转化,但过滤除菌的PEG有更高的转化效率。高压灭菌可能会导致PEG分子量或浓度发生变化,从而影响转化效率。建议选择过滤除菌PEG溶液。

问4:50% PEG溶液过滤除菌太慢是否正常?

答:50% PEG粘稠,针头滤器过滤太慢,可选用大面积的真空抽滤设备除菌。

问5:Carrier DNA是否需要预变性处理以及处理方法?

答:Coolaber的Carrier DNA已经做过变性处理。基于保证转化效率的目的,产品使用前可以再次变性处理。建议分装至PCR管内,于PCR仪(设置98℃ 10 min,4℃ 2 min)处理后冷冻保存。变性Carrier DNA可以反复冻融三次,超过三次需要再次变性处理。

问6:Carrier DNA是否可以由鲑鱼精DNA(高分子量线状,CAT:CS9672)制备以及制备方法?

答:可以。但是制备方法复杂,需要溶解,剪切并测定分子量大小,制备方法参照分子克隆。建议直接选用Coolaber处理好的Carrier DNA(CAT:YT0003)。

问7:YPD Plus Liquid Medium的作用是什么?

答:YPD Plus Liquid Medium用于酵母转化后的复苏培养,经Coolaber检测,在增加复苏培养步骤后,转化子的数量可以增加50%-100%,在文库转化中作用明显。但在互作验证或单个质粒转化实验中,经典转化Kit或Super转化Kit的转化效率完全可以满足实验要求。YPD plus营养丰富,极易污染,产品包装为4×25 mL形式,长期不用请置于-20℃保存。

问8:酵母转化PEG/LiAC混合液的成分和用途?

答:酵母转化PEG/LiAC混合液(CAT:YT0006)由50% PEG、1M LiAC、10×TE按照8:1:1组成。按照每100 μL感受态细胞加入500 μL混合液进行转化反应,具体方法可以参照Coolaber酿酒酵母感受态细胞的使用说明。

问9:1×TE/LiAC混合液(即用型)的成分和用途?

答:1×TE/LiAC混合液(即用型,CAT:YT0009)与通常说的1.1×TE/LiAc浓度一致,成分为110 mM LiAC及1.1×TE。主要用于制备酵母感受态细胞,具体可以参照SK2400或SK2401的使用说明。

问10:菌落转化Kit(SK2390)在什么情况下可以使用?

答:菌落转化Kit可以满足大多数单个或者两个载体转化的实验,在菌落数满足要求的条件下,每μg质粒转化后会得到50个以上的转化子。

酵母转化相关产品的特点及用途:

详询www.coolaber.com

◆ 酵母杂交实验常见问题--筛选培养基篇

◆ 酵母杂交常见问题--富营养培养基篇

◆ 虎年行大运 开学送大礼

↓↓↓

关注我们返回搜狐,查看更多



【本文地址】

公司简介

联系我们

今日新闻


点击排行

实验室常用的仪器、试剂和
说到实验室常用到的东西,主要就分为仪器、试剂和耗
不用再找了,全球10大实验
01、赛默飞世尔科技(热电)Thermo Fisher Scientif
三代水柜的量产巅峰T-72坦
作者:寞寒最近,西边闹腾挺大,本来小寞以为忙完这
通风柜跟实验室通风系统有
说到通风柜跟实验室通风,不少人都纠结二者到底是不
集消毒杀菌、烘干收纳为一
厨房是家里细菌较多的地方,潮湿的环境、没有完全密
实验室设备之全钢实验台如
全钢实验台是实验室家具中较为重要的家具之一,很多

推荐新闻


图片新闻

实验室药品柜的特性有哪些
实验室药品柜是实验室家具的重要组成部分之一,主要
小学科学实验中有哪些教学
计算机 计算器 一般 打孔器 打气筒 仪器车 显微镜
实验室各种仪器原理动图讲
1.紫外分光光谱UV分析原理:吸收紫外光能量,引起分
高中化学常见仪器及实验装
1、可加热仪器:2、计量仪器:(1)仪器A的名称:量
微生物操作主要设备和器具
今天盘点一下微生物操作主要设备和器具,别嫌我啰嗦
浅谈通风柜使用基本常识
 众所周知,通风柜功能中最主要的就是排气功能。在

专题文章

    CopyRight 2018-2019 实验室设备网 版权所有 win10的实时保护怎么永久关闭