跑完步第二天小腿疼的原因如下：

1、一般情况下，跑步后次日小腿痛是由于运动后体内乳酸产生过多，不能完全被身体吸收，在小腿部位堆积引起的肌肉酸痛，可不用太过担心，休息后症状可逐渐改善，局部热敷、按摩有助于缓解症状；

2、如果跑步前没有做热身运动或者突然跑步，且运动速度过快，易导致小腿肌肉痉挛，严重者还会出现胫腓骨骨膜撕裂伤，除小腿疼痛外，往往还伴有行走困难、后蹬动作乏力等，因此当出现上述症状时，一定要引起重视，及时到医院就诊，行X线或CT检查可明确诊断；

3、如果既往有膝关节病变、下肢静脉曲张等疾病，剧烈运动后也可出现小腿疼，除局部治疗改善症状外，还应积极治疗原发病。

因此当跑步后出现小腿疼痛，一定要引起重视，如伴有其他症状或休息后不缓解应及时就诊。