蝴蝶兰Genomic |
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阅读量: 163 作者: 李佐,陈和明,肖文芳,吕复兵 展开 摘要: 由于蝴蝶兰(Phalaenopsis)产业化的蓬勃发展,大量栽培新品种不断涌现。然而,现代农业产业化的推广会造成植物遗传资源的流失,新品种的产生和流行会使传统优良品种大量消失,人工育种对目标性状选择的局限性会减少某些遗传性状的储备,导致遗传多样性的损失。因此对蝴蝶兰遗传多样性的全面研究,无论是对其种质资源多样性的保护,还是对蝴蝶兰资源的可持续利用,都具有极其重要的意义。同时蝴蝶兰资源丰富多样,许多杂交品种在外观、形态上极为相似,难以分辨。本研究中利用蝴蝶兰基因组SSR(Genomic-SSR)与EST-SSR标记来进行区分并探讨种质之间的遗传差异,在此基础上对两类SSR标记进行分析比较,以期为蝴蝶兰相关品种鉴定和遗传分析等研究提供理论依据。试验选取的蝴蝶兰种质采自广东省广州市的"广东名优花卉种质资源圃"。分别对设计好的两类SSR引物(包括30对Genomic-SSR引物与25对EST-SSR引物)进行毛细管电泳检测筛选,获得10对扩增效果较好的引物(包括2对Genomic-SSR引物与8对EST-SSR引物),之后对其加荧光标记重新合成荧光标记引物进行PCR扩增,并采用ABI公司的3730 xl DNA analyzer基因分析仪对所有试材进行多态性检测,之后采用POPGENE和PowerMarker软件进行相关遗传多样性指数的分析。对比两类SSR引物的研究结果,EST-SSR和Genomic-SSR在标记多态性及基因型鉴别等方面均具有显著的遗传差异性,两类标记平均检测到的有效等位基因数(A_e)、Shannon's指数(I)和基因多样性指数(H)差异很小;然而从原候选引物数对比来看,EST-SSR类引物的扩增效率普遍高于Genomic-SSR引物,具有更高的有效性。总体来看,10对SSR引物共扩增出145条带,条带范围从130 bp到532 bp不等,其中144条(99.31%)为多态性条带。每对引物能扩增出的多态性条带数从4条到21条不等,平均每对引物可以扩增出14.4条多态性条带。每条引物扩增出的多态性条带比率在80%到100%之间。平均的多态信息含量指数(PIC)和分子标记指数(MI)值分别为0.66和27.42,因此综合两类SSR引物进行蝴蝶兰遗传多样性的分析评价更全面可靠。 展开 关键词: 蝴蝶兰 Phalaenopsis Genomic-SSR EST-SSR 会议名称: 中国园艺学会学术年会 会议时间: 2015-10-26 会议地点: 中国福建厦门 被引量: 2 |
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