G6PD基因检测是G6PD缺乏症确诊的重要依据，尤其对于女性杂合子、临床疑似而生化诊断不明确或有家族史的患者。女性杂合子由于其X染色体可随机失活，导致部分女性可发病。基因诊断常用检测方法有Sanger测序、高分辨熔解曲线(high resolution melting, HRM)等DNA检测技术。

G6PD基因位于Xq28，长约20 kb，包含13个外显子，编码515个氨基酸的蛋白酶，起始密码子位于第2外显子，第1外显子不参与翻译[1]。目前已报道的致病性变异有214种(http：//www.hgmd.cf.ac.uk/ac/gene.php？gene＝G6PD)。根据相关的表型(WHO建议的酶活性分类)，将G6PD缺乏症的致病性变异分为Ⅰ～Ⅳ类，Ⅰ类致病性变异导致酶活性严重缺乏伴先天性非球形细胞溶血性贫血，主要位于外显子6、10和13，这些致病性变异所编码的氨基酸多位于底物结合区、NADP＋辅酶结合区等重要结构域。Ⅱ类致病性变异导致酶活性严重缺乏；Ⅲ类致病性变异导致酶活性轻中度缺乏；Ⅳ类致病性变异导致酶活性轻度降低或正常(主要为外显子5和9的致病性变异)。大部分导致G6PD缺乏症的致病性变异属于Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类，极少数为Ⅳ类[11]。

我国人群中已发现的G6PD致病性变异超过30种，绝大多数属Ⅱ类或Ⅲ类，分布有种族和地区特异性[11,12,13]。我国常见的致病性变异有9种，分别为c.95A>G(p.His32Arg)、c.392G>T(p.Gly131Val)、c.487G>A(p.Gly163Ser)、c.493A>G(p.Asn165Asp)、c.592C>T(p.Arg198Cys)、c.1024C>T(p.Leu342Phe)、c.1360C>T(p.Arg454Cys)、c.1376G>T(p.Arg459Leu)和c.1388G>A(p.Arg463His)，这9种变异占总变异的90%以上，而其中c.95A>G(p.His32Arg)、c.1376G>T(p.Arg459Leu)和c.1388G>A(p.Arg463His)3种类型最常见，约占总变异的70%～80%[2,12]。因此，基因诊断推荐首先进行热点变异检测的策略。