菏泽高新区位于山东省菏泽市市区西部，辖3个镇街。2008年1月被列为省级高新区。2018年8月，市委、市政府将马岭岗镇纳入高新区管理。截至2022年6月，高新区人口24.8万人。截至2023年9月，高新区面积1499.79公顷。是国家火炬生物医药特色产业基地、国家级知识产权集群化管理试点区、国家科协技术转移中心等[1][2][3]。

菏泽高新区前身是菏泽牡丹工业园区，于2001年底开始规划建设，2006年3月被省政府批准为省级经济技术开发区，2008年1月被省政府列为省级高新技术产业开发区，山东省新型工业化（生物医药产业）示范基地和国家第一批10个知识产权集群化管理试点区之一。