临床上并不存在食物相克的说法，因此巧克力和咖啡可以一起适量吃，两者之间的营养成分并不会发生反应，食用后对人体并无太大影响。但是不建议长期大量一起吃，因为这两种食物热量都比较高，如果长期大量一起吃，可能会使体重增加。

巧克力是以可可浆和可可脂为主要原料制作而成的一种甜食，其含有蛋白质、脂肪、糖类及多种微量元素等营养物质，其中以脂肪与糖类含量较高，是一种热量很高的食物。而咖啡是用经过烘焙磨粉的咖啡豆制作出来的饮料，也含有较高的热量。若长期过量食用巧克力和咖啡，当摄入的能量大于消耗的能量，多余的能量堆积在体内，可能使人变胖。

此外，巧克力与咖啡中都含有一定量的咖啡因，能起到兴奋神经的作用，摄入适量的咖啡因有助于提神。但如果摄入过多咖啡因，可能使神经过度兴奋，造成失眠、多梦等情况。同时需要注意，肥胖者、糖尿病患者及失眠者等更应少食巧克力及咖啡，避免使肥胖、血糖及失眠症状加重。