肌肉萎缩的治疗方案取决于病因，应针对原发疾病制定治疗方案，但营养和锻炼贯穿始终。

对于急性出现的严重肌肉疾病，可能会出现呼吸肌无力，导致呼吸困难甚至呼吸衰竭。对于此类患者需要在急诊或者重症监护室进行监护治疗。

对于系统性疾病如内分泌疾病、肿瘤、感染、颈椎病、腰椎间盘突出等，需要治疗原发疾病。

对于炎症性肌病，治疗的目标是抑制炎症和自身免疫反应，治疗方案需要专科医师评估后制定。

最好避免肌肉萎缩的办法就是多使用，在安全范围内，增加针对肌肉力量的锻炼。

保证每天足够的能量摄入，注意合理饮食搭配，营养均衡。每日所需能量约为25~35kcal/kg，具体还需要根据每日的能量消耗估算。此外，还可摄入一些营养肌肉的药物。

对于炎症性肌病，药物治疗的目标是抑制炎症和自身免疫反应，主要的药物包括：

临床上通常会加用营养肌肉的药物，如肌酸，大剂量维生素E，辅酶Q等帮助延缓肌萎缩，但目前此类药物的有效程度有待进一步循证医学证据证明。

需根据具体病因、原发病决定，比如神经外伤、颈椎病、腰椎间盘突出、神经卡压等，可考虑手术治疗，具体手术方案需咨询专科医生。

有研究显示电针刺激穴位对治疗失神经肌萎缩有一定的治疗效果；但这些中医治疗暂无循证医学证据支持，建议到正规医疗机构，在医师指导下治疗。