轻型：临床症状轻，仅感下腹不适或隐痛，可无明显腹泻，有腹泻者每日可出现排稀糊样便或稀水便 3～5 次。粪便中可找到溶组织内滋养体和包囊。

普通型：起病多缓慢，全身中毒症状轻，少有发热，有食欲减退和轻中度腹痛、腹泻。典型腹泻表现为解粘液血便，每日数次至十余次，量中等，为草莓果酱样伴腐败腥臭味，可有里急后重感（即每次解完大便觉得没解干净，肛门有坠胀感，却又解不出来的感觉）。多数患者可在数日或数周后自行缓解，少数未经治疗或因治疗不彻底易复发或转为慢性。

爆发型：少见，多发生于营养不良、体质虚弱、感染严重、孕妇或使用免疫抑制剂治疗的患者。起病急骤，畏寒、高热、全身衰竭等全身中毒症状重，可有剧烈的肠绞痛，大便次数更多，可达数十次，呈洗肉水样淡红色水便，粪便量多，伴奇臭，伴恶心呕吐。患者容易出现脱水，导致外周循环障碍或意识不清，也非常容易出现肠出血、肠穿孔继发腹膜炎等严重并发症，如抢救不及时，可在 1～2 周内死亡。

慢性阿米巴痢疾：多为急性普通型治疗不及时、不彻底转为慢性型，表现为腹泻与便秘交替出现，腹泻每日 3～5 次，大便多呈糊状，带有少量粘液或血液，时有下腹胀痛，症状可持续数月至数年。体格检查可在腹部摸到团块，为因感染刺激结肠大量肉芽组织增生形成的阿米巴瘤。粪便中多可发现滋养体，发作期可找到包囊。