R语言入门系列之三:R脚本 |
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写在前面: 在前面两篇文章R语言入门系列之一与R语言入门系列之二中,我分别介绍了R语言中的对象与结构、数据的输入输出及可视化。基于前面的基础,今天我介绍一下R语言中基础的程序结构,来帮助我们完成更复杂的数据处理任务。此外,如果你有大批量数据处理、可视化任务,需要着重学习R脚本在命令行的调用方式以及命令行参数的使用方法。 写好的R语言程序一般保存为R脚本,这样在以后完成相似数据处理任务时可以方便地直接调用。在linux系统命令行,我们可以使用“Rscript”命令来调用运行写好的程序,并添加一些必须的命令行参数;在Windows系统的Rstudio中,可以使用source()函数来调用写好的R脚本。 1重复循环 R中的循环主要有for和while结构。for循环重复执行一个语句,直到value值不再包含在向量vector中为止,for结构的基本语法如下所示: 代码语言:javascript复制for (value in vector) { statements }例如我们想要将群落数据小数值转换成百分值,如下所示: 代码语言:javascript复制data=read.table("phylum.txt", header=TRUE) rownames(data)=data[, 1] data=data[, -1] for (i in 1:nrow(data)) { for (j in 1:ncol(data)) { data[i, j]=data[i, j]*100 } }while结构重复执行一个语句,直到条件语句不为TRUE为止,while结构基本语法如下: 代码语言:javascript复制while (condition) { statements }例如上面for的程序可以改写为: 代码语言:javascript复制i=1 while (i |
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