甲状腺炎的发病主要与以下原因有关，例如辐射是导致放射性甲状腺炎的主要原因，而且放射性甲状腺炎，主要是由放射性的核素照射所引起的。

自身免疫紊乱，是导致自身免疫性甲状腺炎的主要原因，这类甲状腺炎发病的时候，主要考虑是由自身免疫调节异常导致的，例如与环境，特殊的生理阶段，遗传等因素，都是有一定关系的。

而感染性甲状腺炎，例如急性化脓性甲状腺炎，亚急性甲状腺炎的发病，主要是与感染有关，例如，细菌，病毒，真菌等病原体的感染。